长已被假定是有遗传、 认知和神经各级对自闭症的特征黑社会的症状的一个常见原因。复杂性出现由于多个基因和环境，不改变 DNA 但是遗传和基因表达影响的表观遗传因素之间的交互。双胞胎的研究表明遗传是 0.7 自闭症和更广泛的自闭症表型，为 0.9，自闭症的兄弟姐妹是 25 倍可能要比一般人口的自闭症。因此，自闭症个案的相当一部分可能是可追溯到的高度遗传但不是继承遗传原因： 就是突变导致自闭症不是父母的基因组中存在。
一些罕见的突变可能会导致自闭症扰乱一些突触的途径，例如那些参与其中的细胞粘附。小鼠基因置换研究表明自闭症患者的症状是后来发展密切相关的步骤，取决于在突触活动以及活动相关的更改。所有已知致畸物质 （导致出生缺陷的代理） 有关的自闭症风险似乎从观念、 首八个星期内行事，虽然这并不排除可能性自闭症可以启动或受影响以后，它是有力的证据自闭症产生很早在发展中。虽然其他环境的原因的证据是坊间已不被证实可靠的研究，促进或加剧自闭症，已提出索赔或可能是重要的环境因素在将来的研究，包括某些食品、 传染病、 重金属、 溶剂、 柴油机排气、 多氯联苯、 邻苯二甲酸盐和酚用塑料制品、 农药、 溴化的阻燃剂、 酗酒、 吸烟、 非法毒品疫苗，父母可能首先成为自闭症的症状，在他们周围的常规疫苗接种，时间的孩子知道和这引起了对理论的疫苗或其防腐剂导致自闭症。尽管这些理论缺乏令人信服的科学证据和生物令人难以置信的是，家长关注自闭症导致降低儿童免疫接种率和麻疹暴发疫情的可能性更大。
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