Em doenças auto-imunes e inflamatórias a condição surge através de reacções aberrantes dos sistemas imunológico humanas inatas ou adaptáveis. Em auto-imunidade, sistema imunológico do paciente é ativado contra as proteínas do corpo. Em doenças inflamatórias, é a reação do sistema imunológico e sua posterior a jusante de sinalização (BVA, IFN, etc), que causa problemas.
Uma minoria substancial da população sofre destas doenças, que muitas vezes são crônicas, debilitante e fatal. Há mais de oitenta doenças causadas por autoimunidade. Estima-se que doenças auto-imunes estão entre as dez principais causas de morte entre as mulheres em todas as faixas etárias acima de 65 anos.
Atualmente, uma quantidade considerável de pesquisa está sendo conduzida em tratamento dessas condições. De acordo com um relatório da Frost & Sullivan, os pagamentos de Aliança total no segmento auto-imune/inflamação de 1997 a 2002 totalizaram US $489.8 milhões, onde Eli Lilly, Suntory, Procter e Gamble, Encysive e Novartis juntos representam 98,6% dos pagamentos da Aliança.
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