生物标志物或生物标记，一般是一种物质，用作生物状态的指示器。它是一种客观测量和评估作为一项指标的正常的生物过程、 致病性进程或治疗干预措施的药理反应特性。它用于在许多科学领域。
在医学上，生物标记物可以是健康的一种物质，引入有机体，以检查器官功能和其他方面。例如，氯化铷用作放射性同位素评价心脏肌肉的灌注。
它还可以检测到其表示特定疾病状态的一种物质，例如，抗体的存在可能指示已感染。更具体地说，标志指示表达式或状态的一种蛋白，关联的风险或级数的一种疾病，或给定的治疗这种疾病的易感性的更改。
生物标志物还可用于表明在流行病学和毒理学的各种环境物质接触。在这些情况下，生物标志物可能是外部的物质本身 （例如石棉粒子或从烟草研究），或由身体 （代谢产物） 处理外部物质的变体。
细胞生物学，生物标志物是一个分子，它允许的检测和隔离的特定单元格类型 （例如，蛋白质 Oct 4 作为生物标志物用于标识胚胎干细胞)。
在遗传学、 生物标记物 （标识为遗传标记） 是导致疾病或疾病易感性与相关联的 DNA 序列。
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