生物標誌物或生物標記，一般是一種物質，用作生物狀態的指示器。它是一種客觀測量和評估作為一項指標的正常的生物過程、 致病性進程或治療干預措施的藥理反應特性。它用於在許多科學領域。
在醫學上，生物標記物可以是健康的一種物質，引入有機體，以檢查器官功能和其他方面。例如，氯化銣用作放射性同位素評價心臟肌肉的灌注。
它還可以檢測到其表示特定疾病狀態的一種物質，例如，抗體的存在可能指示已感染。更具體地說，標誌指示運算式或狀態的一種蛋白，關聯的風險或級數的一種疾病，或給定的治療這種疾病的易感性的更改。
生物標誌物還可用於表明在流行病學和毒理學的各種環境物質接觸。在這些情況下，生物標誌物可能是外部的物質本身 （例如石棉粒子或從煙草研究），或由身體 （代謝產物） 處理外部物質的變體。
細胞生物學，生物標誌物是一個分子，它允許的檢測和隔離的特定儲存格類型 （例如，蛋白質 Oct 4 作為生物標誌物用於標識胚胎幹細胞)。
在遺傳學、 生物標記物 （標識為遺傳標記） 是導致疾病或疾病易感性與相關聯的 DNA 序列。
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