Flu Burung (H5N1) Genetika

Strain yang dikenal pertama HPAI A (H5N1) (disebut A/chicken/Scotland/59) membunuh dua kawanan ayam di Skotlandia pada tahun 1959, tetapi ketegangan yang sangat berbeda dari strain patogenik tinggi H5N1 saat ini. Strain dominan HPAI A (H5N1) pada tahun 2004 berevolusi 1999-2002 menciptakan genotipe Z. Hal ini juga disebut "garis keturunan Asia HPAI A (H5N1)".

Asia keturunan HPAI A (H5N1) dibagi menjadi dua clades antigenik. "Clade 1 meliputi isolat manusia dan burung dari Vietnam, Thailand, dan Kamboja dan isolat burung dari Laos dan Malaysia Clade 2 virus pertama kali diidentifikasi pada isolat burung dari Cina, Indonesia, Jepang, dan Korea Selatan sebelum menyebar ke barat ke Timur Tengah., Eropa, dan Afrika clade 2 virus telah terutama bertanggung jawab untuk infeksi H5N1 manusia yang terjadi selama akhir tahun 2005 dan 2006, menurut WHO.. Analisis genetik telah mengidentifikasi enam subclades dari clade 2, tiga yang memiliki distribusi geografis yang berbeda dan memiliki telah terlibat dalam infeksi manusia.

  • Subclade 1, Indonesia
  • Subclade 2, Eropa, Timur Tengah, dan Afrika (disebut EMA)
  • Subclade 3, Cina "

Sebuah studi 2007 difokuskan pada subclade EMA telah menjelaskan lebih lanjut tentang mutasi EMA. "Para 36 isolat baru yang dilaporkan di sini sangat memperluas jumlah seluruh data sekuens genom tersedia dari flu burung baru-baru ini (H5N1) isolat Sebelum proyek kami, GenBank hanya berisi 5 genom lengkap lainnya dari Eropa untuk periode 2004-2006,. Dan berisi tidak seluruh genom dari Timur Tengah atau Afrika Utara. Analisis kami menunjukkan beberapa temuan baru. Pertama, semua sampel Eropa, Timur Tengah, dan Afrika jatuh ke dalam clade yang berbeda dari lainnya Klade kontemporer Asia, semua yang berbagi nenek moyang yang sama dengan . asli 1997 Hong Kong pohon filogenetik galur dibangun pada masing-masing 8 segmen menunjukkan gambaran yang konsisten dari 3 garis keturunan, seperti yang digambarkan oleh pohon HA ditunjukkan pada Gambar 1 Dua Klade mengandung isolat secara eksklusif Vietnam;. yang lebih kecil dari ini, dengan 5 isolat, kita label V1; yang klade yang lebih besar, dengan 9 isolat, adalah V2 The tersisa 22 isolat semua jatuh ke dalam clade, ketiga jelas berbeda, label EMA, yang terdiri dari sampel dari Eropa, Timur Tengah, dan Afrika Pohon untuk.. lainnya 7 segmen menampilkan topologi yang sama, dengan Klade V1, V2, dan EMA jelas terpisah dalam setiap kasus. Analisis dari semua influenza lengkap tersedia (H5N1) genom dan 589 urutan HA menempatkan klade EMA sebagai berbeda dari clades utama yang beredar di DPR Republik Cina, Indonesia, dan Asia Tenggara. "

Colorized transmission electron micrograph of Avian influenza A H5N1 viruses (seen in gold) grown in MDCK cells (seen in green).
Transmisi elektron mikrograf berwarna dari Avian influenza A virus H5N1 (terlihat dalam emas) tumbuh dalam sel-sel MDCK (terlihat dalam hijau).

Terminologi

H5N1 isolat diidentifikasi seperti ini misalnya A aktual HPAI (H5N1), A/chicken/Nakorn-Patom/Thailand/CU-K2/04 (H5N1):

  • Sebuah singkatan dari spesies influenza (A, B atau C).
  • ayam spesies isolat ditemukan di
  • Nakorn-Patom/Thailand adalah tempat ini diisolasi virus tertentu
  • CU-K2 mengidentifikasi dari virus influenza lainnya terisolasi di tempat yang sama
  • 04 mewakili tahun 2004
  • H5 singkatan untuk kelima jenis dikenal beberapa protein hemaglutinin.
  • N1 singkatan yang pertama dari jenis dikenal beberapa protein neuraminidase.

Contoh lain termasuk: Sebuah itik / / Hong Kong/308/78 (H5N3), A/avian/NY/01 (H5N2), A/chicken/Mexico/31381-3/94 (H5N2), dan A / shoveler / Mesir / 03 (H5N2).

Seperti dengan lainnya virus flu burung, H5N1 strain disebut "sangat patogen" (HP) dan "rendah patogen" (LP). Virus flu burung yang menyebabkan HPAI sangat virulen, dan tingkat kematian pada unggas yang terinfeksi sering mendekati 100%. Virus LPAI memiliki virulensi diabaikan, tetapi virus ini dapat berfungsi sebagai nenek moyang untuk virus HPAI. Strain H5N1 saat ini bertanggung jawab atas kematian burung di seluruh dunia adalah strain HPAI; semua strain H5N1 saat ini lainnya, termasuk strain Amerika Utara yang menyebabkan penyakit tidak ada sama sekali dalam setiap spesies, strain LPAI. Semua strain HPAI diidentifikasi sampai saat ini telah melibatkan subtipe H5 dan H7. Perbedaan kekhawatiran patogenisitas pada unggas, bukan manusia. Biasanya virus yang sangat patogen burung tidak patogen yang sangat baik untuk manusia atau non-unggas burung. Strain mematikan H5N1 saat ini tidak biasa dalam menjadi mematikan bagi begitu banyak spesies, termasuk beberapa, seperti kucing domestik, tidak pernah sebelumnya rentan terhadap virus flu.

Struktur dan genetik subtipe terkait

H5N1 adalah subtipe dari spesies Influenza A''''virus dari genus Influenzavirus''A''dari keluarga Orthomyxoviridae''''. Seperti semua influenza subtipe A lainnya, subtipe H5N1 merupakan virus RNA. Ia memiliki genom tersegmentasi dari delapan arti negatif, satu-helai RNA, disingkat PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, MP dan NS.

HA kode untuk hemaglutinin, suatu glikoprotein antigen yang ditemukan pada permukaan virus influenza dan bertanggung jawab untuk mengikat virus ke sel yang terinfeksi. Kode NA untuk neuraminidase, sebuah enzim antigen glikosilasi ditemukan pada permukaan virus influenza. Ini memfasilitasi pelepasan virus dari sel yang terinfeksi progeni.

The hemagglutinin (HA) dan neuraminidase (NA) RNA untai menentukan struktur protein yang paling medis yang relevan sebagai target untuk obat antivirus dan antibodi. HA dan NA juga digunakan sebagai dasar penamaan yang berbeda subtipe virus influenza A. Ini adalah tempat''H''dan''N''berasal dari dalam''''H5N1.

Virus influenza A adalah signifikan untuk potensi mereka untuk penyakit dan kematian pada manusia dan hewan lainnya. Influenza subtipe virus yang telah dikonfirmasi pada manusia, dalam urutan jumlah kematian diketahui pandemi manusia bahwa mereka telah menyebabkan, meliputi:

  • H1N1, yang menyebabkan pandemi flu 1918 ("flu Spanyol") dan saat ini menyebabkan flu manusia musiman dan 2009 pandemi flu ("flu babi")
  • H2N2, yang menyebabkan "flu Asia"
  • H3N2, yang menyebabkan "flu Hong Kong" dan saat ini penyebab flu musiman manusia
  • H5N1, ("flu burung"), yang terkenal karena memiliki regangan (Asia-linage HPAI H5N1) yang membunuh lebih dari setengah menginfeksi manusia, menginfeksi dan membunuh spesies yang tidak pernah diketahui menderita dari virus influenza sebelumnya (misalnya kucing) , tidak mampu dihentikan oleh pemusnahan semua unggas yang terlibat - sebagian orang berpikir karena menjadi endemik pada burung liar, dan menyebabkan miliaran dolar yang akan dihabiskan dalam persiapan pandemi flu dan preventiveness
  • H7N7, yang memiliki potensi zoonosis yang tidak biasa dan menewaskan satu orang
  • H1N2, yang saat ini endemik pada manusia dan babi dan penyebab flu musiman manusia
  • H9N2, yang telah menginfeksi tiga orang
  • H7N2, yang telah menginfeksi dua orang
  • H7N3, yang telah menginfeksi dua orang
  • H10N7, yang telah menginfeksi dua orang

Patogen H5N1 Rendah

Rendah patogen flu burung H5N1 (LPAI H5N1) juga disebut "Amerika Utara" H5N1 biasanya terjadi pada burung liar. Dalam kebanyakan kasus, hal itu menyebabkan sakit ringan atau tidak ada tanda-tanda nyata dari penyakit pada burung. Hal ini tidak diketahui mempengaruhi manusia sama sekali. Satu-satunya kekhawatiran tentang itu adalah bahwa adalah mungkin untuk itu untuk ditransmisikan kepada unggas dan unggas bermutasi menjadi strain patogenik tinggi.

  • 1975 - LPAI H5N1 terdeteksi pada seekor bebek mallard liar dan angsa biru liar di Wisconsin.
  • 1981 dan 1985 - LPAI H5N1 terdeteksi pada itik oleh University of Minnesota melakukan prosedur sampling di mana bebek sentinel dipantau di kandang ditempatkan di alam liar untuk waktu singkat.
  • 1983 - LPAI H5N1 terdeteksi pada cincin-burung camar ditagih di Pennsylvania.
  • 1986 - LPAI H5N1 terdeteksi pada seekor bebek liar di Ohio mallard.
  • 2005 - LPAI H5N1 terdeteksi pada itik di Manitoba, Kanada.
  • 2008 - LPAI H5N1 terdeteksi pada itik di Selandia Baru.
  • 2009 - LPAI H5N1 terdeteksi pada unggas komersial di British Columbia.

"Di masa lalu, tidak ada persyaratan untuk pelaporan atau pelacakan LPAI H5 atau H7 deteksi pada burung liar sehingga negara dan universitas menguji sampel burung liar independen dari USDA. Karena itu, daftar di atas deteksi sebelumnya mungkin tidak semua termasuk dari masa lalu LPAI H5N1 deteksi. Namun, Organisasi Dunia untuk Kesehatan Hewan (OIE) baru saja mengubah kebutuhannya pelaporan deteksi flu burung. Efektif pada tahun 2006, semua dikonfirmasi LPAI H5 dan H7 AI subtipe harus dilaporkan kepada OIE karena potensi mereka untuk bermutasi menjadi strain patogenik tinggi. Oleh karena itu, kini memantau USDA deteksi ini pada burung liar, kawanan halaman belakang, kambing domba komersial dan pasar unggas hidup. "

Tinggi laju mutasi

Virus influenza memiliki laju mutasi yang relatif tinggi yang merupakan karakteristik dari virus RNA. Segmentasi genom memfasilitasi rekombinasi genetik dengan reassortment segmen pada host yang terinfeksi dengan dua virus influenza yang berbeda pada waktu yang sama. Ini tidak berarti bahwa satu substitusi asam amino dapat menyebabkan pandemi, tetapi tidak berarti bahwa satu substitusi asam amino dapat menyebabkan virus flu burung yang tidak patogen pada manusia untuk menjadi patogen pada manusia.

Virus influenza A subtipe H3N2 bersifat endemik pada babi di China, dan telah terdeteksi pada babi di Vietnam, meningkatkan kekhawatiran munculnya strain varian baru. Strain yang dominan virus flu tahunan pada bulan Januari 2006 adalah H3N2, yang sekarang resisten terhadap amantadine obat standar antivirus dan rimantadine. Kemungkinan pertukaran gen H5N1 dan H3N2 melalui reassortment merupakan perhatian utama. Jika reassortment di H5N1 terjadi, mungkin tetap menjadi subtipe H5N1, atau bisa menggeser subtipe, seperti H2N2 lakukan ketika itu berkembang menjadi strain Flu Hong Kong H3N2.

Baik H2N2 dan H3N2 strain pandemi avian influenza virus yang terkandung segmen RNA. "Sementara virus influenza pandemi manusia 1957 (H2N2) dan 1968 (H3N2) secara jelas muncul melalui reassortment antara virus manusia dan avian, virus influenza menyebabkan 'flu Spanyol' di tahun 1918 tampaknya seluruhnya berasal dari sumber unggas".

Bacaan lebih lanjut


Artikel ini berlisensi di bawah Lisensi Creative Commons Attribution-ShareAlike . Ini menggunakan bahan dari artikel Wikipedia pada " influenza A subtipe virus H5N1 "Semua bahan yang digunakan diadaptasi dari Wikipedia tersedia di bawah persyaratan Lisensi Creative Commons Attribution-ShareAlike . Wikipedia ® itu sendiri adalah merek dagang terdaftar dari Wikimedia Foundation, Inc

Last Updated: Feb 1, 2011

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | العربية | Dansk | Nederlands | Finnish | Ελληνικά | עִבְרִית | हिन्दी | Bahasa | Norsk | Русский | Svenska | Magyar | Polski | Română | Türkçe
Comments
The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post