选择一个名称为 CFS 极具挑战，因为缺乏共识内的临床、 科研、 和病人社区对其定义的特征和原因。不同的机构，疾病，中枢神经系统、 代谢、 传染性或感染、 心血管、 免疫系统或精神障碍，查看 CFS 和还考虑并不是单一的同构障碍的可能性。
随着时间的推移，和在不同的国家很多名字已与条件相关联。除了 CFS，使用一些其他名称包括阿库雷里病、 良性肌性脑脊髓炎、 慢性疲劳免疫功能障碍综合征、 慢性传染性单核细胞增多、 流行肌性脑脊髓炎、 流行的 neuromyasthenia、 冰岛疾病、 肌性脑脊髓炎、 肌脑炎、 脑肌病、 post-viral 疲劳综合征、 中缝核脑病、 皇家自由疾病、 塔帕努伊流感和雅痞流感 （现在考虑贬义）。许多患者宁愿一个不同的名称，如脑脊髓"肌炎"，相信 trivializes 名称"慢性疲劳综合征"的条件，防止它被看作是一个严重的健康问题，并不利于研究。1999 年审查解释皇家医学院的医生、 精神病学家，和普通科医生在 1996 年倡导慢性疲劳综合征的肌性脑脊髓炎或 ME，被广泛地应用在英国，"因为有了，到目前为止，没有公认的病理学在肌肉和中枢神经系统是暗示我一词"而不是使用 1996 年报告收到一些人接受但也严厉批评病人意见已被排除。2002 年，柳叶刀评论注意到最近发布的报告"CFS 工作组 / 我"用折衷名称 CFS / 我说，"这一事实使用了两种疾病的名称象征尊重不同观点虽然承认继续缺乏一个普遍接受的名称一致。"
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