克罗恩病可引起肠，包括梗阻、 瘘管和脓肿内几个机械并发症。从狭窄或粘连的窄腔，封锁肠内容通常发生在梗阻。瘘可以开发之间两个循环的肠、 膀胱与肠、 阴道，与肠和肠道与皮肤之间。脓肿是不开放的感染，腹部或克罗恩病患者肛门周围地区可能发生的集合。
克罗恩病还增加了该地区的炎症的癌症的风险。例如，涉及小肠克罗恩病的人都处在小肠癌风险较高。同样，罗恩结肠炎患者有 5.6 患上结肠癌的相对风险。与结肠镜检查大肠癌筛查建议已罗恩结肠炎至少八年的人。一些研究表明在预防大肠癌罗恩涉及结肠 ； chimioprotection 的作用提出了两个代理，叶酸和 mesalamine 的筹备工作。
克罗恩病的个人有很多原因，包括减少的食物的摄入和吸收不良营养不良的危险。小肠切除术后增加了风险。这种个人可能需要口服补充剂增加其热量的摄入量，或在严重的病例，全静脉营养 (TPN)。中重度克罗恩病的大多数人所提一位营养学家求助的营养。
克罗恩病会导致严重的并发症，包括肠梗阻、 脓肿、 免费穿孔及出血。
在怀孕期间，克罗恩病可能有问题，一些药物可能导致胎儿或母亲不良结局。咨询产科和克罗恩病和所有药物 gastroenterologist 允许采取预防性措施。在某些情况下，缓解可以在怀孕期间会发生。某些药物，也可能影响精子计数或可能产生不利影响受孕的一个人的能力
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