克罗恩病的很多人有症状诊断之前多年。通常的发病是 15 岁至 30 岁之间，但可发生于任何年龄。由于 '修修补补' 胃肠道疾病的性质和组织参与的深度，最初的症状可能会比溃疡性结肠炎更模糊。克罗恩病的人会发作和减免的时期。
胃肠道症状
腹痛可能是为首发症状的克罗恩病。它往往被伴随腹泻，尤其是在那些已经做了手术。腹泻可能或不可能流血。人往往有过外科手术或多个手术最终的胃肠道短肠综合征。克罗恩病患者腹泻的性质取决于小肠或所涉及的冒号的一部分。回肠炎通常会产生大量水样大便。体积小的频率较高的粪便可能会导致结肠炎。粪便一致性的范围可以从固体到水。在严重的情况下，个人可能有每日超过 20 大便，可能需要唤醒晚上到大便。可见出血由粪便中是不常见的比克罗恩病溃疡性结肠炎，但罗恩结肠炎的设置，可以看到。克罗恩病也可能与原发性硬化性胆管炎，一种类型的胆道炎症相关联。
肛周不适也可能在克罗恩病突出。痕痒或肛门周围疼痛可能暗示的炎症，造或脓肿肛门部位大便失禁周围可能伴随着围肛门克罗恩病。胃肠道的另一端，嘴里可能受非愈合溃疡 (口疮)。很少，可能涉及的食道和胃在克罗恩病。这可能会导致症状包括难以吞咽 (吞咽障碍）、 上腹痛、 呕吐。
全身症状
克罗恩病，像许多其他慢性、 炎症性疾病，可能会导致多种全身症状。虽然发烧超过 38.5 ˚C (101.3 ˚F） 不常见的除非有一种并发症如脓肿人们广泛小肠疾病也可能吸收不良的碳水化合物或血脂，这可能进一步加剧减肥，还可能存在，发烧。
肠外症状
除了系统性和胃肠道的参与，克罗恩病可以影响许多其他器官系统。曝光 (畏光） 时，尤其是炎症的内部部分的眼睛，称为葡萄膜炎，可能会导致眼痛。炎症也可能涉及的眼睛 (巩膜），一种叫作 episcleritis 的白色部分。如果未经处理的 episcleritis 和葡萄膜炎可导致失明。
克罗恩病是疾病的关联类型为 rheumatologic 称为阴性脊柱关节病。这组疾病特点是炎症的一个或多个节点 （关节炎） 或肌肉插入 （肌腱端炎)。关节炎可以影响较大关节，如膝或肩或完全可能涉及的小关节的手和脚。关节炎可能还涉及到脊椎，导致强直性脊柱炎如果涉及整个脊柱或只骶如果只涉及较低的脊柱。关节炎的症状包括关节痛、 温馨、 肿、 硬和联合移动或函数的损失。
克罗恩病也可能涉及皮肤、 血液、 内分泌系统。一种类型的皮肤表现，红斑结节，显示为红色结节，通常出现在胫骨。红斑结节是由于底层的皮下脂肪的炎症和间隔脂膜炎的特点是。另一种皮肤损伤，脓皮病性脓皮病，通常是痛苦的 ulcerating 结节。克罗恩病也会增加血凝块 ； 风险尽管呼吸困难可能造成肺栓塞的痛苦肿胀的腿的下部可以是深静脉血栓形成，标志。自身免疫性溶血性贫血、 免疫系统的攻击的血红细胞的条件也很多常见的克罗恩病，并可能导致疲劳、 苍白的脸色和其他常见的贫血的症状。夜总会，畸形的手指，两端的也可能是克罗恩病的结果。最后，克罗恩病可能会导致骨质疏松症，或变薄的骨头。骨质疏松症的人都处在骨骨折的风险增加。
克罗恩病也会导致神经系统并发症 （据报在达 15%的病人）。最常见的是癫痫发作、 中风、 肌病、 周围神经病变、 头痛和抑郁。
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