克羅恩病的很多人有症狀診斷之前多年。通常的發病是 15 歲至 30 歲之間，但可發生于任何年齡。由於 '修修補補' 胃腸道疾病的性質和組織參與的深度，最初的症狀可能會比潰瘍性結腸炎更模糊。克羅恩病的人會發作和減免的時期。
胃腸道症狀
腹痛可能是為首發症狀的克羅恩病。它往往被伴隨腹瀉，尤其是在那些已經做了手術。腹瀉可能或不可能流血。人往往有過外科手術或多個手術最終的胃腸道短腸綜合征。克羅恩病患者腹瀉的性質取決於小腸或所涉及的冒號的一部分。回腸炎通常會產生大量水樣大便。體積小的頻率較高的糞便可能會導致結腸炎。糞便一致性的範圍可以從固體到水。在嚴重的情況下，個人可能有每日超過 20 大便，可能需要喚醒晚上到大便。可見出血由糞便中是不常見的比克羅恩病潰瘍性結腸炎，但羅恩結腸炎的設置，可以看到。克羅恩病也可能與原發性硬化性膽管炎，一種類型的膽道炎症相關聯。
肛周不適也可能在克羅恩病突出。痕癢或肛門周圍疼痛可能暗示的炎症，造或膿腫肛門部位大便失禁周圍可能伴隨著圍肛門克羅恩病。胃腸道的另一端，嘴裡可能受非癒合潰瘍 (口瘡)。很少，可能涉及的食道和胃在克羅恩病。這可能會導致症狀包括難以吞咽 (吞咽障礙）、 上腹痛、 嘔吐。
全身症狀
克羅恩病，像許多其他慢性、 炎症性疾病，可能會導致多種全身症狀。雖然發燒超過 38.5 ˚C (101.3 ˚F） 不常見的除非有一種併發症如膿腫人們廣泛小腸疾病也可能吸收不良的碳水化合物或血脂，這可能進一步加劇減肥，還可能存在，發燒。
腸外症狀
除了系統性和胃腸道的參與，克羅恩病可以影響許多其他器官系統。曝光 (畏光） 時，尤其是炎症的內部部分的眼睛，稱為葡萄膜炎，可能會導致眼痛。炎症也可能涉及的眼睛 (鞏膜），一種叫作 episcleritis 的白色部分。如果未經處理的 episcleritis 和葡萄膜炎可導致失明。
克羅恩病是疾病的關聯類型為 rheumatologic 稱為陰性脊柱關節病。這組疾病特點是炎症的一個或多個節點 （關節炎） 或肌肉插入 （肌腱端炎)。關節炎可以影響較大關節，如膝或肩或完全可能涉及的小關節的手和腳。關節炎可能還涉及到脊椎，導致強直性脊柱炎如果涉及整個脊柱或只骶如果只涉及較低的脊柱。關節炎的症狀包括關節痛、 溫馨、 腫、 硬和聯合移動或函數的損失。
克羅恩病也可能涉及皮膚、 血液、 內分泌系統。一種類型的皮膚表現，紅斑結節，顯示為紅色結節，通常出現在脛骨。紅斑結節是由於底層的皮下脂肪的炎症和間隔脂膜炎的特點是。另一種皮膚損傷，膿皮病性膿皮病，通常是痛苦的 ulcerating 結節。克羅恩病也會增加血凝塊 ； 風險儘管呼吸困難可能造成肺栓塞的痛苦腫脹的腿的下部可以是深靜脈血栓形成，標誌。自身免疫性溶血性貧血、 免疫系統的攻擊的血紅細胞的條件也很多常見的克羅恩病，並可能導致疲勞、 蒼白的臉色和其他常見的貧血的症狀。夜總會，畸形的手指，兩端的也可能是克羅恩病的結果。最後，克羅恩病可能會導致骨質疏鬆症，或變薄的骨頭。骨質疏鬆症的人都處在骨骨折的風險增加。
克羅恩病也會導致神經系統併發症 （據報在達 15%的病人）。最常見的是癲癇發作、 中風、 肌病、 周圍神經病變、 頭痛和抑鬱。
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