Las familias de ADN polimerasa

Sobre la base de homología de secuencia, ADN polimerasas se pueden subdividir en siete familias diferentes: A, B, C, D, X, Y, y RT.

La familia de un

Polimerasas contienen replicación y reparación de las polimerasas. Miembros de la replicación de esta familia incluyen la ampliamente estudiada T7 ADN polimerasa, así como los eucariotas γ del ADN mitocondrial de la polimerasa. Entre las polimerasas de reparación son''E. coli''ADN pol I'',''Thermus aquaticus pol I, y Bacillus stearothermophilus''''pol I. Estas polimerasas de reparación están involucrados en la reparación de la escisión y el procesamiento de los fragmentos de Okazaki generados durante la síntesis de cadena retrasada.

La familia B

Polimerasas contienen principalmente polimerasas replicativas e incluyen las principales eucariotas ADN polimerasas α, δ, ε, (ver las letras griegas) y la ADN polimerasa ζ. Familia B también incluye las ADN polimerasas codificadas por algunas bacterias y bacteriófagos, de los cuales la mejor caracterizada es de T4, Phi29, y bacteriófagos RB69. Estas enzimas están involucradas en ambos adelantados y atrasados ​​capítulo de síntesis durante la replicación. Una característica distintiva de la familia B de polimerasas es la síntesis de ADN durante la replicación muy fiel. Mientras que muchos tienen una intrínseca 3'-5 'corrección actividad exonucleasa, ADN polimerasas eucariotas α y ζ son dos ejemplos de polimerasas de la familia B carecen de esta actividad de corrección.

Familia C

Polimerasas son las principales enzimas bacterianas de replicación cromosómica. ADN polimerasa III subunidad alfa del''E. coli''es la subunidad catalítica y no posee ninguna conocida actividad de nucleasa. Una subunidad independiente, la subunidad epsilon, posee la 3'-5 'exonucleasa utilizado para la edición durante la replicación de los cromosomas. La investigación reciente ha clasificado polimerasas de la familia C como una subcategoría de la familia X.

Familia D

Polimerasas todavía no están muy bien caracterizados. Todos los ejemplos más conocidos se encuentran en el subdominio Euryarchaeota de Archaea, y se cree que son las polimerasas replicativa.

La familia X

Contiene el conocido β pol eucariotas polimerasa, así como de otras polimerasas eucariotas como σ pol, pol λ, μ pol, y desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT). Pol β se requiere a corto parche de reparación por escisión de base, una vía de reparación del ADN, que es esencial para la reparación de los sitios abasic. Pol λ y μ Pol participan en extremos no homólogos a participar, un mecanismo para reunirse con el ADN de doble filamento se rompe. TDT sólo se expresa en el tejido linfoide, y añade que "los nucleótidos n" a las roturas de doble hebra formada durante la V para promover la diversidad inmunológica. La levadura Saccharomyces cerevisiae''''sólo tiene una polimerasa Pol X, Pol4, que participa en extremos no homólogos a participar.

Y la familia

Polimerasas difieren de otros en tener una baja fidelidad en las plantillas sin daños y en su habilidad para replicarse a través del ADN dañado. Los miembros de esta familia son por lo tanto llamado translesión síntesis (TLS) polimerasas. Dependiendo de la lesión, las polimerasas TLS puede evitar el daño de una manera libre de errores o propenso a errores, el último resultado en la mutagénesis elevada. Xeroderma pigmentoso variante (XPV) de los pacientes, por ejemplo, tienen mutaciones en el gen que codifica η Pol (ETA), que está libre de errores de la radiación UV-lesiones. En los pacientes XPV, alternativa a errores polimerasas, por ejemplo, Polζ (zeta) (polimerasa ζ es una polimerasa de la familia B de un complejo de la subunidad catalítica REV3L con Rev7, que se asocia con Rev1), se cree que participan en los errores que se traducen en la predisposición al cáncer de estos pacientes. Otros miembros en los seres humanos son Pol ι (iota), Pol κ (kappa), y Rev1 (terminal deoxycytidyl transferasa). En E. coli, dos polimerasas TLS, Pol IV (DinB) y PolV (2 UmuD 'C), son conocidos.

Familia RT

La familia de la transcriptasa inversa contiene ejemplos de ambos retrovirus y polimerasas eucariotas. Las polimerasas de eucariotas son generalmente se limita a telomerasas. Estas polimerasas utilizar una plantilla de ARN para sintetizar la cadena de ADN.

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