El tratamiento para las fístulas varía dependiendo de la causa y el alcance de la fístula, pero a menudo implica la intervención quirúrgica combinada con la terapia con antibióticos.
Normalmente, el primer paso en el tratamiento de la fístula es un examen por un médico para determinar el alcance y "camino" que lleva a la fístula a través del tejido.
En algunos casos la fístula se encuentra temporalmente sujeta, por ejemplo, una fístula provocada por el paladar hendido se trata a menudo con un obturador palatino para retrasar la necesidad de la cirugía a una edad más apropiada.
Con frecuencia requiere cirugía para asegurar un adecuado drenaje de la fístula (de modo que el pus puede escapar sin la formación de un absceso). Varios procedimientos quirúrgicos se utilizan comúnmente, más comúnmente fistulotomía, la colocación de un sedal (un cordón que pasa a través de la trayectoria de la fístula para mantenerla abierta para el drenaje), o un procedimiento de colgajo endorrectal (donde el tejido sano se coloca sobre el lado interno de la fístula para mantener las heces u otros materiales de infectar el canal). Tratamientos con relleno de la fístula con cola de fibrina o conectarlo con tapones de submucosa porcina intestino delgado también se han explorado en los últimos años, con éxito variable. La cirugía de las fístulas anorrectales no está exenta de efectos secundarios, incluyendo la recurrencia, la reinfección y la incontinencia.
Es importante tener en cuenta que el tratamiento quirúrgico de una fístula, sin diagnóstico o tratamiento de la enfermedad subyacente, si existe, no es recomendable. Por ejemplo, el tratamiento quirúrgico de las fístulas en la enfermedad de Crohn puede ser eficaz, pero si la enfermedad de Crohn en sí misma no es tratada, la tasa de recurrencia de la fístula es muy alta (por encima del 50%).
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