Caractéristiques du génome : virus infectieux ont 3 principaux gènes codant pour des protéines virales dans l'ordre : 5´-gag-pol-env-3´.
Il y a des gènes additionnels (également appelés gènes accessoires) selon le virus (p. ex., pour le VIH-1: vif, RPV, vpu, tat, rev, nef) dont les produits sont impliqués dans la régulation de la synthèse et l'ARN viral et autres fonctions réplicatifs de traitement.
Le terminal Long répétition (LTR) est sur 600nt depuis longtemps, dont la région U3 est 450, le r sequence 100 et dans la région de U5 quelque 70 nt long.
Des protéines virales impliquées dans les premiers stades de la réplication comprennent la Transcriptase inverse et l'intégrase. La Transcriptase inverse (RT) est l'ARN-dépendante ADN polymérase virale codé.
L'enzyme utilise le génome d'ARN viral comme un modèle pour la synthèse d'une copie d'ADN complémentaire. RT a également l'activité de la destruction du RNA-modèle RNaseH.
L'intégrase (IN) lie les deux l'ADNc viral générée par la RT et l'hôte ADN. Traitement de la LTR par IN est effectué avant l'insertion du génome viral dans l'hôte ADN.
Bien que la transmission est généralement par l'intermédiaire de particules infectieuses, lentivirus sont capables d'infecter les cellules voisines en contact direct avec les cellules hôtes, sans avoir à former des particules extracellulaires.
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