脂蛋白体中处理称为脂蛋白代谢。它分为两个途径，外源性和内源性，在很大程度取决是否涉的脂蛋白由主要的食物 （外来） 脂类或是否他们起源于肝脏 （生）。
外源性途径
易衬小肠的上皮细胞吸收脂类从饮食。这些血脂、 三酸甘油酯、 磷脂和胆固醇，包括与载脂蛋白 B-48 组装到脂餐。这些新生的脂餐从肠上皮细胞分泌到淋巴循环，在很大程度取决于载脂蛋白 B-48 的过程中。他们分发通过淋巴管新生脂餐绕过肝流通，到血液流经胸导管通过。
在血液中高密度脂蛋白颗粒捐载脂蛋白 C-Ⅱ 和载脂蛋白 E 到新生改变乳糜微粒 ；改变乳糜微粒现在被认为是成熟的。通过载脂蛋白 C 二、 成熟脂餐激活脂蛋白脂肪酶 (LPL)，对衬砌血管内皮细胞的酶。LPL 乳糖水解的甘油三酯 （即共价键加入三个脂肪酸的甘油)，最终释放甘油和脂肪酸从脂餐。然后可以在外围组织，特别是脂肪和肌肉，能源和存储吸收甘油和脂肪酸。
水解的脂餐现考虑改变乳糜微粒遗留物。改变乳糜微粒遗留继续循环直到通过载脂蛋白 E 的改变乳糜微粒残体，主要在肝脏中找到它们的交互。这种相互作用引起的内吞作用改变乳糜微粒的遗留问题，随后水解内溶酶体。溶酶体水解释放甘油和脂肪酸到该单元格，可以用于能源或存储供以后使用。
内源性途径
肝脏是脂蛋白，主要是 VLDL 的另一个重要来源。甘油三酯和胆固醇与载脂蛋白 B 100 组装形式 VLDL 粒子。新生 VLDL 粒子被释放到血液中通过一个过程，它取决于载脂蛋白 B-100。
如在代谢改变乳糜微粒，载脂蛋白 C-Ⅱ 和载脂蛋白 E 的 VLDL 粒子所得高密度脂蛋白颗粒。一旦满载载脂蛋白 E 和 C 二，新生 VLDL 粒子被认为是成熟的。
再像脂餐，VLDL 粒子循环和遇到 LPL 表示对血管内皮细胞。载脂蛋白 C-II 激活 LPL，造成 VLDL 粒子的水解和释放的甘油和脂肪酸。这些产品可以从血液吸收周围组织，主要是脂肪和肌肉。水解的 VLDL 粒子现在称为 VLDL 遗留或中间密度脂蛋白 (IDLs)。VLDL 遗留可以流通和载脂蛋白 E 与残体的相互作用，通过肝脏，被吸收或他们可以进一步水解肝脂酶。
肝脂酶水解释放甘油和脂肪酸，留下 IDL 遗留问题，称为低密度脂蛋白 (LDL)，其中包含相对较高的胆固醇含量。低密度脂蛋白循环和肝脏和外周血细胞被吸收。其目标组织的低密度脂蛋白结合发生互动的低密度脂蛋白受体和载脂蛋白 B 100 或 E 低密度脂蛋白颗粒。吸收发生内吞，通过和化低密度脂蛋白颗粒水解溶酶体，释放血脂、 胆固醇主要内。
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