Per alcune cause di meningite, profilassi può essere fornita a lungo termine con vaccino o a breve termine con antibiotici.
Negli anni ottanta, molti paesi hanno incluso l'immunizzazione contro Haemophilus influenzae di tipo b in loro regimi di vaccinazione di routine infanzia. Questo ha praticamente eliminato questo agente patogeno come causa di meningite nei bambini piccoli in quei paesi. Nei paesi dove è più alto il carico di malattia, tuttavia, il vaccino è ancora troppo costoso. Allo stesso modo, l'immunizzazione contro la parotite ha portato ad un forte calo del numero di casi di meningite parotite, che prima di vaccinazione avvenne nel 15% di tutti i casi di parotite.
Vaccini meningococcus esistono contro i gruppi A, C, W135 e Y. Nei paesi dove è stato introdotto il vaccino per il gruppo meningococcus C, casi causati da questo agente patogeno sono diminuiti notevolmente. Un vaccino quadrivalente ora esiste, che unisce tutti i vaccini quattro contro. Immunizzazione con il vaccino ACW135Y contro quattro ceppi è ora un obbligo di visto per aver preso parte nel Hajj. Sviluppo di un vaccino contro meningococchi di gruppo b si è dimostrato molto più difficile, come le proteine della superficie (che sarebbero normalmente utilizzate per fare un vaccino) solo suscitare una risposta debole da parte del sistema immunitario, o cross-react con normali proteine umane. Ancora, alcuni paesi (Nuova Zelanda, Cuba, Norvegia e Cile) hanno sviluppato i vaccini contro il locali ceppi di meningococchi b di gruppo; alcuni hanno mostrato buoni risultati e sono utilizzati in programmi di immunizzazione locale.
Vaccinazione di routine contro Streptococcus pneumoniae con il vaccino coniugato pneumococco (PCV), che è attivo contro sette sierotipi comuni di questo agente patogeno, riduce significativamente l'incidenza di meningite pneumococcica. Il vaccino pneumococcica polisaccaride, che copre 23 ceppi, viene somministrato solo in determinati gruppi (per esempio coloro che hanno avuto una splenectomia, la rimozione chirurgica della milza); esso non suscitare una risposta immunitaria significativa in tutti i destinatari, ad esempio piccoli bambini.
Vaccinazione infantile con Bacillus Calmette-Guérin è stata segnalata a ridurre sensibilmente il tasso di meningite tubercolare, ma la sua efficacia calante in età adulta ha indotto una ricerca di un vaccino migliore.
La profilassi antibiotica a breve termine è anche un metodo di prevenzione, in particolare di meningite meningococcica. Nei casi di meningite meningococcica, trattamento profilattico di stretti contatti con antibiotici (ad esempio la rifampicina, Ciprofloxacina o ceftriaxone) può ridurre il loro rischio di contrarre la condizione, ma non protegge contro le infezioni del future.
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