腦膜炎的一些原因，可以提供預防疫苗，長期或短期使用抗生素。
自上世紀 80 年代，許多國家包括其兒童常規免疫接種方案 B 型流感嗜血桿菌免疫。這實際上已消滅這病原體為腦膜炎的年幼子女在這些國家中的一個原因。在其中的疾病負擔是最高的國家，但是，疫苗仍然是太貴了。同樣，已導致免疫接種流行性腮腺炎流行性腮腺炎病毒性腦膜炎，接種疫苗之前，所有的流行性腮腺炎病例的 15%發生的病例數急劇下降。
腦膜炎球菌疫苗存在針對 A、 C、 W135 和 Y 的群體。在 C 組腦膜炎球菌疫苗問世的國家，這種病菌引起的案件大幅下降。一次四價疫苗現在存在，它結合了所有四種疫苗。ACW135Y 四株疫苗接種現在是簽證要求參加朝聖。組 B meningococci 疫苗的研製已證明困難得多，作為其表面蛋白 (，通常用來生產疫苗） 只引起免疫系統，從弱反應或 cross-react 與正常的人類蛋白質。一些國家 （新西蘭、 古巴、 挪威和智利） 仍，有開發組 B meningococci ； 本地株疫苗一些已取得良好的成果，用於在本地進行接種。
肺炎鏈球菌肺炎球菌結合疫苗 (PCV)，這是抗七常見血清型這病原體的活性，與常規疫苗接種肺炎球菌腦膜炎的發病率將大大減少。肺炎球菌多糖疫苗，其中包括 23 株，只被管理中某些群體 （例如那些曾有脾切除術的手術切除脾） ；它不會引起重大的免疫反應的所有收件人，如小的孩子。
兒童疫苗接種的芽孢桿菌卡介 Guérin 已報告大大減少率的結核性腦膜炎，但成年後其減弱的有效性，促使搜索更好的疫苗。
短期的預防性應用抗生素也是一種預防，特別是腦膜炎的方法。腦膜炎雙球菌感染個案，用抗生素 (如利福平、 環丙沙星或頭孢曲松鈉) 的密切接觸者預防性治療可降低其風險承包條件，但不能防止未來感染。
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