Non trattata, la meningite batterica è quasi sempre fatale. Meningite virale, al contrario, tende a risolversi spontaneamente e raramente è fatale. Con il trattamento, la mortalità (rischio di morte) da meningite batterica dipende dall'età del paziente e la causa sottostante. Tra i pazienti neonato, il 20-30% può morire da un episodio di meningite batterica. Questo rischio è molto più bassa nei bambini più grandi, la cui mortalità è circa il 2%, ma risorge a circa il 19-37% negli adulti. Negli adulti, il 66% di tutti i casi emergono senza disabilità. I problemi principali sono la sordità (nel 14%) e deficit cognitivo (nel 10%).
Malattia meningococcica si presenta in epidemie in zone dove molte persone vivono insieme per la prima volta, come la caserma durante la mobilitazione, campus universitari
Ci sono differenze significative nella distribuzione locale delle cause di meningite batterica. Per esempio,''N. meningitidis''gruppi B e C causare episodi più malattia in Europa, mentre il gruppo A meningococchi sono più comuni in Cina e tra i pellegrini Hajj. Nella "cintura della meningite" d'Africa, gruppo A e C meningococchi causa la maggior parte delle epidemie. Gruppo W135 meningococchi hanno causato diverse epidemie recenti in Africa e durante l'Hajj. Queste differenze si prevede di modificare ulteriormente come i vaccini contro ceppi comuni vengono introdotti. Allo stesso modo, l'immunizzazione contro la parotite ha portato ad una forte diminuzione del numero di casi di parotite meningite, che prima della vaccinazione si è verificato nel 15% dei casi di parotite. Nei paesi in cui è stato introdotto il vaccino per il meningococco di gruppo C, i casi provocati da questo patogeno sono diminuite considerevolmente. Il vaccino pneumococcico polisaccaridico, che comprende 23 ceppi, viene somministrato solo in alcuni gruppi (ad esempio coloro che hanno avuto una splenectomia, la rimozione chirurgica della milza), ma non suscitare una risposta immunitaria di tutti i soggetti, ad esempio, bambini piccoli.
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