Δομή του RNA

Από Dr Ananya Mandal, MD

RNA είναι ένα ενιαίο λανθάνον μόριο που περιέχουν ζάχαρη α Ριβόζη. Έχει μια χαρακτηριστική δομή και, σε αντίθεση με το DNA, υπάρχουν παραλλαγές και διάφορα είδη RNA δομές.

Η βασική δομή του RNA

Η βασική δομή του RNA, ωστόσο, μπορεί να περιγράφεται ως μια Ριβόζη ζάχαρης, η οποία είναι αριθμημένα από το 1' 5', μέσω της με:

  • μια βάση που επισυνάπτεται στην θέση 1»
  • μια ομάδα υδροξυλίου στη θέση 2'
  • μια φωσφορική επισυνάπτεται η θέση 3' της μία Ριβόζη και η θέση 5' της επόμενης
Ribonucleic acid (RNA) has the bases adenine (A), cytosine (C), guanine (G), and uracil (U).
Το Ριβονουκλεϊκό οξύ (RNA) έχει το βάσεων αδενίνη (Α), (C) Κυτοσίνη, γουανίνη (G) και ουρακίλη (U). Εικόνα πιστωτικής: Εθνικό Ινστιτούτο γενική ιατρική Επιστημών

Βάσεις RNA

Μία βάση είναι συνδεδεμένη με το 1' θέση, γενικά αδενίνη (Α), η κυτοσίνη (C), η γουανίνη (G) ή ουρακίλη (U).

Αδενίνη και η γουανίνη είναι πουρίνες; Κυτοσίνη και η ουρακίλη είναι pyrimidines. Οι βάσεις μπορούν να αποτελούν υδρογονικοί δεσμοί μεταξύ κυτοσίνη και η γουανίνη, μεταξύ αδενίνη και η ουρακίλη και μεταξύ γουανίνη και η ουρακίλη.

Σε αντίθεση με το DNA που περιέχει μόνο τέσσερις βάσεις Α, Τ, G και C, ώριμο RNA μπορεί να περιέχει τροποποιημένο βάσεις και σάκχαρα.

Pseudouridine (Ψ), στο οποίο η διασύνδεση μεταξύ ουρακίλη και Ριβόζη αλλάζει από ένα C–N ομόλογο σε ένα C–C ομόλογο, και ribothymidine (T), βρίσκονται σε διάφορα σημεία. Ένα άλλο αξιοσημείωτο τροποποιημένων βάσης είναι hypoxanthine, μια deaminated αδενίνη βάση των οποίων Νουκλεοζίτης ονομάζεται inosine (I).

Ομάδα υδροξυλίου RNA

Υπάρχει παρουσία μιας ομάδας υδροξυλίου από τη θέση του 2' της ζάχαρης Ριβόζη. Αυτό κάνει διαφορετικό από DNA RNA και καθιστά το RNA θεσπίζει μια γεωμετρία φόρμας αντί για Β-μορφή πιο συχνά παρατηρούνται στο DNA. Αυτό σημαίνει ότι υπάρχει ένα πολύ βαθύ και στενό μεγάλων groove και αυλάκωση ρηχά και ευρεία ήσσονος σημασίας.

Η ομάδα του υδροξυλίου σε 2' σημαίνει ότι στις ευέλικτες περιοχές της ένα μόριο RNA χημικές ουσίες μπορούν να επιτεθούν το διπλανό phosphodiester ομολόγων να προσκολληθούμε τη σπονδυλική στήλη.

RNA φωσφορική ομάδα

Μια φωσφορική ομάδα είναι συνδεδεμένη με τη θέση 3' της μία Ριβόζη και η θέση 5» της επόμενης.

Οι ομάδες φωσφορικό ασβέστιο έχουν αρνητικό φορτίο. Αυτό καθιστά το RNA ένα φορτισμένο μόριο (polyanion).

Τριτογενής δομή του RNA

Μόλις σχηματιστεί η RNA, όπως πρωτεΐνες απαιτεί να υποστούν αλλαγές να σχηματίσουν μια ειδική δομή της τριτοβάθμιας. Πεθάνει στη λαιμητόμο για τη δομή αυτή παρέχεται από δευτερεύοντα διαρθρωτικά στοιχεία τα οποία υδρογονικοί δεσμοί εντός του μορίου. Το σκέλος αποτελεί hairpin βρόχους, σφαιροειδείς και εσωτερικούς βρόχους. Δεδομένου ότι χρεώνεται RNA, μεταλλικά ιόντα όπως Mg2 + χρειάζονται να σταθεροποιήσει πολλές δευτερογενείς και τριτογενείς δομές.

Τριτογενή δομές RNA προσδιορίζονται χρησιμοποιώντας χημικά διερεύνηση και τροποποίηση αντιστοίχιση παρεμβολές, πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR), κρυσταλλογραφία ακτίνων χ και cryo-ηλεκτρονική μικροσκοπία.

Επανεξετάζονται από Απρίλιο Cashin-Garbutt, BA Hons (Cantab)

Πηγές

  1. http://Biology.Kenyon.edu/courses/biol63/watson_06.pdf
  2. http://www.Biology.Creative-Chemistry.org.uk/Documents/N-Bio-06.pdf
  3. http://www.liver-EG.org/includes/Lectures/Bio/Rna.pdf
  4. http://www.saylor.org/site/wp-content/Uploads/2010/11/BIO101-DNA-vs-Rna.pdf
  5. http://Rna.cshl.edu/Content/Free/Chapters/04_rna_world_2nd.pdf
  6. http://SMB.slac.stanford.edu/~Ash/nsb_genomics/011_doudna_rna.pdf

Περαιτέρω ανάγνωση

Last Updated: Oct 14, 2012

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | العربية | Dansk | Nederlands | Finnish | Ελληνικά | עִבְרִית | हिन्दी | Bahasa | Norsk | Русский | Svenska | Magyar | Polski | Română | Türkçe
Comments
The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post