疫苗不能保证完整的保护，从一种疾病。有时，这是因为宿主的免疫系统只是没有反应充分或根本。这可能是由于降低免疫力一般 (糖尿病、 类固醇、 艾滋病毒感染） 或由于宿主的免疫系统没有 B 细胞能产生抗体的抗原。
即使在主机发展抗体，人体的免疫系统不完善，在任何情况下免疫系统可能仍然无法击败感染。
佐剂通常用于增强免疫反应。铝佐剂最常使用，但一些疫苗和角鲨烯与更多的疫苗还可用于佐剂像角鲨烯和磷酸佐剂正在进行测试。
效能或性能是疫苗的取决于多个因素：
- 疾病本身 （对于某些疾病预防接种执行比其他疾病）
- （一些疫苗接种是疾病的不同菌株） 疫苗的应变 [http://bmj.bmjjournals.com/cgi/content/full/319/7206/352
- 是否一个存放疫苗接种时间表
- 一些个人是 '非急救员' 某些疫苗，也就是说它们不生成抗体即使正确预防接种
- 其他因素，例如种族或遗传易感性
疫苗接种的个人不会发展这种疾病免疫接种，可能会温和比不接种疫苗的情况下这种疾病。
以下是重要的考虑因素： 效力的疫苗接种程序：
- 小心建模预测免疫接种运动将在中、 长期疾病的流行病学产生的影响
- 以下介绍的一种新疫苗的有关疾病的持续监测和
- 即使病已成为罕见保持高免疫接种率。
1958 年有 763,094 例麻疹和 552 人死亡美国。新疫苗的帮助下，个案数目下降到少于 150 每年 （56 的中位数）。纠纷产生了道德、 伦理、 有效性和疫苗的安全性。主流医学专家的意见是大大防止痛苦和死亡的严重传染性疾病的好处大于风险罕见免疫接种后的不良反应。疫苗接种批评家说疫苗是预防疾病无效或疫苗安全性研究不足。和一些政治团体反对强制性接种疫苗对个人自由的理由。
大多数疫苗发展到目前为止一直依赖政府、 高校和非盈利组织提供资金的推力。很多的疫苗已高成本效益和对公众的健康有益。可能是由于政府法规和支持，而不是经济诱因。
许多研究人员和决策者要求采取不同的方式，使用 '拉' 机制激励产业。如奖品、 税收抵免或预先市场承诺机制可以确保金融回报，以艾滋病毒疫苗研制成功的公司。如果政策是精心设计的它可能还确保人能获得一种疫苗，如果开发。
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