Årsagerne til fibromyalgi kendes ikke, men der er formentlig en række faktorer involveret. Mange mennesker forbinder udviklingen af fibromyalgi med et fysisk eller følelsesmæssigt belastende eller traumatiske begivenhed, såsom en bilulykke. Nogle slutte den til gentagne skader. Andre link det til en sygdom. Mennesker med leddegigt og andre autoimmune sygdomme, såsom lupus, er særligt tilbøjelige til at udvikle fibromyalgi. For andre, synes fibromyalgi at opstå spontant.
Mange forskere undersøger andre årsager, herunder problemer med, hvordan det centrale nervesystem (hjernen og rygmarven) processer smerter.
Nogle forskere spekulere, at en persons gener kan regulere den måde, hans eller hendes krop processer smertefulde stimuli. Ifølge denne teori, kan mennesker med fibromyalgi har et gen eller gener, der forårsager dem til at reagere kraftigt på stimuli, at de fleste mennesker ikke ville opfatte som smertefuld. Men disse gener - hvis de faktisk eksisterer - er ikke blevet identificeret.
Relaterede artikler