Le cause della fibromialgia sono sconosciute, ma ci sono probabilmente una serie di fattori coinvolti. Molta gente associa lo sviluppo della fibromialgia con un evento fisicamente o emotivamente stressante o traumatico, come un incidente automobilistico. Alcuni collegarlo a lesioni ripetitive. Altri collegarlo ad una malattia. Persone con artrite reumatoide e altre malattie autoimmuni, come il lupo, sono particolarmente suscettibili di sviluppare la fibromialgia. Per gli altri, fibromialgia sembra che si formano spontaneamente.
Molti ricercatori stanno esaminando altre cause, tra cui problemi con come il sistema nervoso centrale (cervello e midollo spinale) elabora il dolore.
Alcuni scienziati ipotizzano che i geni di una persona possono disciplinare il modo in cui che il suo corpo elabora stimoli dolorosi. Secondo questa teoria, persone con fibromialgia possono avere un gene o i geni che causano loro di reagire fortemente agli stimoli che la maggior parte delle persone sarebbero non percepiamo come dolorosa. Tuttavia, quei geni - se, in realtà, esistono - non sono state identificate.
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