Wat is Genomica?

De Genomica is de studie van de genomen van organismen. Het gebied omvat intensieve inspanningen om de volledige opeenvolging van DNA van organismen en inspanningen van de fijn-schaal de genetische afbeelding te bepalen.

Het gebied omvat ook studies van intragenomic fenomenen zoals heterosis, epistasis, pleiotropy en andere interactie tussen plaatsen en alleles binnen het genoom. In tegenstelling, is het onderzoek van de rollen en de functies van enige genen een belangrijkste aandacht van moleculaire biologie of genetica en is een gemeenschappelijk onderwerp van modern medisch en biologisch onderzoek. Het Onderzoek van enige genen valt niet in de definitie van genomica tenzij het doel van dit genetisch, weg, en functionele informatieanalyse zijn effect op, plaats binnen, en reactie op de netwerken van het volledige genoom nader toe te lichten is.

Voor het Agentschap van de Milieubescherming van Verenigde Staten, de „term „genomica“ omvat een breder werkingsgebied van wetenschappelijke onderzoek bijbehorende technologieën dan toen de genomica aanvankelijk werd overwogen. Een genoom is het somtotaal van alle genen van een individueel organisme. Aldus, bedraagt de genomica de studie van alle genen van een cel, of weefsel, DNA (genotype), mRNA (transcriptome), of eiwit (proteome) niveaus.“

De Genomica werd gevestigd door Fred Sanger toen hij eerst de volledige genomen van een virus en een mitochondrion rangschikte. Zijn groep vestigde technieken om te rangschikken, genoomafbeelding, gegevensopslag, en bioinformatic analyses in de 1970-jaren '80.

Een belangrijke tak van genomica is nog betrokken met het rangschikken van de genomen van diverse organismen, maar de kennis van volledige genomen heeft tot de mogelijkheid voor het gebied van functionele genomica geleid, hoofdzakelijk betreffende patronen van genuitdrukking tijdens diverse voorwaarden.

De belangrijkste hulpmiddelen zijn hier microarrays en bio-informatica. De Studie van de volledige reeks proteïnen in een een celtype of weefsel, en de veranderingen tijdens diverse voorwaarden, worden genoemd proteomics.

Een verwant concept is materiomics, die als studie van de materiële eigenschappen van biologische materialen (b.v. hiërarchische eiwitstructuren en materialen, gemineraliseerde biologische weefsels, enz.) en hun effect op de macroscopische functie en mislukking in hun biologische context wordt gedefinieerd, die processen, structuur en eigenschappen verbindt bij veelvoudige schalen door een benadering van de materialenwetenschap.

De daadwerkelijke term „genomica wordt“ verondersteld door Dr. Tom Roderick, een geneticus bij het Laboratorium van Jackson (de Haven van de Bar, ME) op een vergadering gemunt te zijn die in Maryland op de afbeelding van het menselijke genoom in 1986 wordt gehouden.

In 1972, was Walter Fiers en zijn team bij het Laboratorium van Moleculaire Biologie van de Universiteit van Gent (Gent, België) de eerste om de opeenvolging van een gen te bepalen: het gen voor de laagproteïne van de Bacteriofaag MS2. In 1976, bepaalde het team de volledige nucleotide-opeenvolging van bacteriofaag ms2-RNA. Het eerste op DNA-Gebaseerde genoom dat in al zijn onderdelen moet worden gerangschikt was dat van bacteriofaag φ-X174; (5.368 bp), gerangschikt door Frederick Sanger in 1977.

Het eerste vrij-leeft te rangschikken organisme was dat van „Hemophilus - influenzae“ in 1995, en sindsdien de genomen worden in een vlug tempo gerangschikt.

Vanaf September 2007, werd de volledige opeenvolging gekend van ongeveer 1879 virussen, 577 bacteriële species en ruwweg 23 eukaryote organismen, waarvan over de helft paddestoelen zijn.

De Meeste bacteriën de waarvan genomen volledig zijn gerangschikt zijn problematisch ziekte-veroorzakend agenten, zoals „Hemophilus - influenzae“. Van de andere gerangschikte species, het meest werden gekozen omdat zij goed bestudeerde modelorganismen waren of goede modellen beloofden te worden. De Gist („Saccharomyces cerevisiae“) is lang een belangrijk modelorganisme voor de eukaryotic cel geweest, terwijl de fruitvlieg „Fruitvliegje melanogaster“ een zeer belangrijk hulpmiddel (in het bijzonder in vroege pre-moleculaire genetica) is geweest. De worm „Caenorhabditis elegans“ is een vaak gebruikt eenvoudig model voor multicellular organismen. Zebrafish „rerio van Brachydanio wordt“ gebruikt voor vele ontwikkelingsstudies over het moleculaire niveau en de bloem „thaliana van Arabidopsis“ is een modelorganisme voor bloeiende installaties. Japanse pufferfish („Takifugu rubripes“) en bevlekte groene pufferfish („nigroviridis Tetraodon“) zijn interessant wegens hun kleine en compacte genomen, die zeer weinig niet-codeert DNA in vergelijking met de meeste species bevatten.

Een ruw ontwerp van het menselijke genoom werd voltooid door het Menselijke Project dat van het Genoom begin 2001, tot veel fanfare leidt. Tegen 2007 werd de menselijke opeenvolging verklaard „gebeëindigd“ (minder dan één fout in 10.000 geassembleerde basissen en alle chromosomen. De Vertoning van de resultaten van het project vereiste significante bio-informaticamiddelen. De opeenvolging van de menselijke verwijzingsassemblage kan worden onderzocht gebruikend Browser van het Genoom UCSC.


Dit artikel is vergunning gegeven onder de Creatieve Vergunning van toewijzing-ShareAlike van het Lagerhuis. Het gebruikt materiaal van het artikel van Wikipedia op „Genomica“ Al aangepast materiaal dat van Wikipedia wordt gebruikt in het kader van de termijnen van de Creatieve Vergunning van toewijzing-ShareAlike van het Lagerhuis beschikbaar is. Wikipedia® zelf is een gedeponeerd handelsmerk van de Wikimedia Stichting, Inc.

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Русский | Svenska | Polski
Comments
The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post