Was ist Genomics?

Genomics ist die Untersuchung der Genome von Organismen. Das Feld umfasst intensive Anstrengungen, um die gesamte DNA-Sequenz von Organismen und feinskaligen genetische Kartierung Anstrengungen zu bestimmen.

Das Feld umfasst auch Studien von intragenomic Phänomene wie Heterosis, Epistase, Pleiotropie und andere Wechselwirkungen zwischen Loci und Allele innerhalb des Genoms. Im Gegensatz dazu ist die Untersuchung der Rollen und Funktionen der einzelnen Gene ein Schwerpunkt Molekularbiologie oder Genetik und ist ein gemeinsames Thema der modernen medizinischen und biologischen Forschung. Forschung einzelner Gene nicht in die Definition der Genomik fallen, es sei denn das Ziel dieser genetischen, Weg und funktionelle Analyse von Informationen ist es, seine Wirkung auf zu klären, statt, und die Reaktion auf das gesamte Genom-Netzwerke.

Für die United States Environmental Protection Agency ", der Begriff" Genomics "umfasst einen breiteren Anwendungsbereich der wissenschaftlichen Untersuchung verbundenen Technologien als wenn Genomik wurde zunächst berücksichtigt. Ein Genom ist die Summe aller individuelle Organismus Gene. So, Genomik der Studie ist alle Gene einer Zelle oder Gewebe an der DNA (Erbgut), mRNA (Transkriptom), oder Protein (Proteom) Ebenen. "

Genomics wurde von Fred Sanger gegründet, als er die kompletten Genome von einem Virus und einem Mitochondrium ersten sequenziert. Seine Gruppe etablierten Techniken der Sequenzierung, Genom-Kartierung, Speicherung und bioinformatischen Analysen in den 1970-1980er Jahren.

Ein wichtiger Zweig der Genomik ist immer noch mit Sequenzierung der Genome von verschiedenen Organismen, sondern um das Wissen der vollständigen Genome hat die Möglichkeit, für den Bereich der funktionellen Genomik geschaffen, vor allem mit Muster der Genexpression während der verschiedenen Schiffen besorgt.

Die wichtigsten Werkzeuge sind hier Microarrays und Bioinformatik. Studium der volle Satz von Proteinen in einer Zelle eingeben oder Gewebe, und die Veränderungen während der verschiedenen Bedingungen, heißt Proteomik.

Ein verwandtes Konzept ist materiomics, die als das Studium der Materialeigenschaften von biologischem Material (z. B. hierarchische Proteinstrukturen und Materialien, mineralisierten biologischen Geweben, etc.) und deren Auswirkungen auf das makroskopische Funktion und Versagen in ihrem biologischen Kontext definiert wird, Verknüpfung von Prozessen , Struktur und Eigenschaften auf mehreren Skalen durch eine Materialwissenschaften Ansatz.

Der eigentliche Begriff "Genomics" wird gedacht, durch Dr. Tom Roderick, Genetiker an der Jackson Laboratory (Bar Harbor, ME) bei einem Treffen in Maryland über die Kartierung des menschlichen Genoms im Jahr 1986 statt geprägt worden.

In 1972 wurden Walter Fiers und sein Team am Laboratorium für Molekulare Biologie der Universität Ghent (Gent, Belgien) die ersten, die Sequenz eines Gens zu bestimmen: das Gen für Bakteriophagen MS2-Hüllprotein. Im Jahr 1976 ermittelt das Team den kompletten Nukleotid-Sequenz des Bakteriophagen MS2-RNA. Die erste DNA-basierte Genom in seiner Gesamtheit sequenziert werden sollte, dass der Bakteriophagen Φ-X174, (5368 bp), sequenziert von Frederick Sanger im Jahre 1977.

Der erste frei lebende Organismus sequenziert werden sollte, dass der''Haemophilus influenzae''im Jahr 1995, und seitdem Genome werden in einem rasanten Tempo sequenziert.

Ab September 2007 wurde die vollständige Sequenz von etwa 1879 Viren, 577 Bakterienarten und rund 23 Eukaryonten Organismen, von denen etwa die Hälfte sind Pilze bekannt.

Die meisten der Bakterien, deren Genom vollständig sequenziert sind problematisch Krankheitserreger, wie zB''Haemophilus influenzae''. Von den anderen Arten sequenziert wurden die meisten gewählt, weil sie gut untersuchten Modellorganismen wurden oder zu versprechen, gute Modelle zu werden. Hefe (Saccharomyces cerevisiae'''') ist seit langem ein wichtiger Modellorganismus für die eukaryotischen Zelle, während der Fruchtfliege Drosophila melanogaster''''ein sehr wichtiges Instrument (insbesondere in der frühen pre-molekulare Genetik) wurde. Der Wurm Caenorhabditis elegans''''ist eine häufig verwendete einfache Modell für mehrzellige Organismen. Der Zebrafisch''Brachydanio rerio''ist für viele Entwicklungsstudien auf molekularer Ebene verwendet und die Blume''Arabidopsis thaliana''ist ein Modell-Organismus für blühende Pflanzen. Der japanische Kugelfisch (''Takifugu rubripes'') und der Grüner Kugelfisch (''Tetraodon nigroviridis'') sind wegen ihrer kleinen und kompakten Genomen interessant, mit sehr wenig nicht-codierende DNA im Vergleich zu den meisten Arten.

Eine Rohfassung des menschlichen Genoms wurde von der Human Genome Project im Frühjahr 2001 abgeschlossen und damit viel Tamtam. Bis zum Jahr 2007 der humanen Sequenz erklärt wurde "fertig" (weniger als ein Fehler in 10.000 Basen und alle Chromosomen zusammengesetzt. Anzeige der Ergebnisse des Projekts erforderte erhebliche Bioinformatik-Ressourcen. Die Sequenz des menschlichen Referenz-Montage erkundet werden mit der UCSC Genome Browser werden .


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