מהו גנומיקה?

גנומיקה הוא חקר genomes של אורגניזמים. השדה כולל מאמצים אינטנסיביים כדי לקבוע את רצף ה-DNA שלם של אורגניזמים מיפוי גנטי של פיין-סרגל מאמצים.

השדה כולל גם לימודי intragenomic תופעות כגון heterosis, אפיסטזה, פליאוטרופיה האינטראקציות האחרות בין אללים בתוך הגנום רוח המקום. לעומת זאת, החקירה של התפקידים ופונקציות של גנים יחיד הוא המוקד העיקרי של ביולוגיה מולקולרית או גנטיקה והוא נושא משותף של מחקר רפואי, ביולוגית מודרנית. מחקר של גנים יחיד לא מתחלקים ההגדרה של גנומיקה אלא אם המטרה של זה גנטי, לשביל ומידע פונקציונלי ניתוח הוא להבהרת השפעתו, הצב, ותגובת לרשתות של הגנום כולו.

עבור סוכנות ההגנה ' איכות הסביבה ארצות הברית ', ' המונח "גנומיקה" מכסה טווח רחב יותר של חקירה מדעית משויכת טכנולוגיות מאשר כאשר גנומיקה נחשב בתחילה. הגנום הוא הסכום הכולל של כל בודד אורגניזם של הגנים. לכן, גנומיקה הוא חקר הגנים של תאים או רקמות, ב ה DNA (גן # מושגים בסיסיים), ה-mRNA (transcriptome), או ה-רמות חלבון (פרוטאום)".

גנומיקה הוקמה על ידי פרד סנגר כאשר הוא וסודרו תחילה genomes מלאה של וירוס, של מיטוכונדריון. הקבוצה שלו הקים טכניקות של רצף, מיפוי הגנום, אחסון נתונים, ניתוחים bioinformatic 1970 שנות השמונים.

סניף ראשי של גנומיקה הוא מודאג עדיין עם קביעת רצף genomes של אורגניזמים שונים, אך ידע מלא genomes יצרה את האפשרות עבור השדה של גנומיקה פונקציונלית, הנוגעים בעיקר דפוסי ביטוי גנים במהלך לתנאים שונים.

הכלים החשובים ביותר כאן הם מיקרו-מערכים לביואינפורמטיקה. מחקר של הערכה המלאה של חלבונים מסוג תאים או רקמות, השינויים במהלך תנאים שונים, נקרא פרוטאומיקס.

מושג קרוב הוא materiomics, המוגדר כחקר תכונות החומר של חומרים ביולוגיים (מבני חלבון ההיררכי למשל, חומרים, mineralized ברקמות ביולוגיות, וכו ') ואת השפעתם על הפונקציה מאקרוסקופית וכשל בהקשר הביולוגיים שלהם, קישור תהליכים, מבנה ומאפיינים ב סולמות מרובים באמצעות גישה הנדסת חומרים.

המונח בפועל "גנומיקה" נחשב טבע על ידי ד ר טום רודריק, גנטיקאי ב המעבדה ג'קסון (בר הרבור, ME) בפגישה שנערכה ב מרילנד בהמיפוי של הגנום האנושי בשנת 1986.

בשנת 1972, וולטר Fiers והצוות שלו ב מעבדה בביולוגיה מולקולרית של אוניברסיטת גנט (גנט, בלגיה) היו הראשונים כדי לקבוע את רצף גנים: ג'ין עבור חלבון מעיל Bacteriophage MS2. בשנת 1976, הצוות לקבוע רצף נוקלאוטיד מלאה של bacteriophage MS2-RNA. הגנום הראשון המבוסס על ה-DNA כדי להיות וסודרו בשלמותו היתה bacteriophage באופן-X 174; (5,368 bp), הנמצא ברצף על ידי פרדריק סנגר בשנת 1977.

האורגניזם אל-אווירני עצמאי הראשון להיות וסודרו היתה '-Haemophilus influenzae' בשנת 1995, ומאז ולאחר מכן genomes וסודרו בקצב מואץ.

בספטמבר 2007, רצף ביצוע היה ידוע של וירוסים 1879 בערך, 577 מינים חיידקי אורגניזמים איקריוטיים 23 בערך, בערך חצי מהם ופטריות.

רוב החיידקים יש כבר וסודרו לחלוטין genomes שלו הם גורם המחלה בעייתי סוכנים, כגון '-Haemophilus influenzae'. המינים הנמצא ברצף אחרים, רוב נבחרו משום שהם אורגניזם מודל well-studied או הבטיח להפוך דגמים טובים. שמרים ('שמר האפייהשל ') מזה זמן רב אורגניזם מודל חשוב עבור תא eukaryotic, בעוד זבוב הפירות '-melanogaster דרוזופילה"היה כלי חשוב מאוד (בעיקר בתחום גנטיקה pre-molecular המוקדמות). תולעת '-Caenorhabditis elegans' היא דוגמנית פשוט בשימוש לעיתים קרובות עבור אורגניזמים multicellular. דג זברה '-Brachydanio rerio' משמש עבור מחקרים התפתחותיים רבים ברמה מולקולרית, הפרח '-תודרנית לבנה' הוא אורגניזם מודל צמחים בעלי פרחים. Pufferfish יפני ('Takifugu rubripesשל '), pufferfish ירוק המאותר ('Tetraodon nigroviridisשל ') מעניינים בשל שלהם genomes קטן, קומפקטי, המכיל מעט מאוד DNA-קידוד לעומת רוב המינים.

טיוטה של הגנום האנושי הושלמה על-ידי פרויקט הגנום האנושי בתחילת 2001, יצירת הרבה תרועה. 2007 הרצף האנושי הוכרז "סיום" (שגיאה אחת פחות מ 10,000 בסיסים, התכנסו כל כרומוזום. הצגת תוצאות הפרוייקט נדרש משאבים לביואינפורמטיקה משמעותית. הרצף של מכלול ההתייחסות האנושית האמתית באמצעות דפדפן הגנום של UCSC.


מאמר זה מוענק תחת רישיון ייחוס-שיתוף זהה גירסאות מלאי יצירתי. היא משתמשת בחומר מתוך ויקיפדיה מאמר ב- "גנומיקה" כל החומר הותאם בשימוש מתוך ויקיפדיה זמין תחת תנאי רישיון ייחוס-שיתוף זהה גירסאות מלאי יצירתי. ® ויקיפדיה עצמה הינו סימן מסחרי רשום של קרן ויקימדיה, inc.

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | العربية | Dansk | Nederlands | Filipino | Finnish | Ελληνικά | עִבְרִית | हिन्दी | Bahasa | Norsk | Русский | Svenska | Magyar | Polski | Română | Türkçe
Comments
The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
(optional)
Post