ゲノミクスは何ですか。

ゲノミクスは有機体のゲノムの調査です。 フィールドは有機体および良スケールの遺伝のマップの努力の全体の DNA シーケンスを定めるための集中的な努力を含んでいます。

フィールドはまたゲノム内の位置と対立遺伝子間のヘテロシス、 epistasis、 pleiotropy および他の相互作用のような intragenomic 現象の調査を含んでいます。 それに対して、役割の調査および単一の遺伝子の機能は分子生物学または遺伝学の一次焦点で、現代医学および生物的研究の共通のトピックです。 単一の遺伝子の研究はゲノミクス場所全体のゲノムのネットワークへの、および応答の定義にこの遺伝、パスおよび機能情報分析の目標が効果を明瞭にすることでなければ下りません。

米国の環境保護庁のために、ゲノミクスが最初に考慮されたときに 「ターム 「はゲノミクス」科学的な調査関連技術のより広いスコープをより取囲みます。 ゲノムはすべての総数個人の有機体の遺伝子です。 従って、ゲノミクスは DNA (遺伝子型)、 mRNA (transcriptome)、または蛋白質 (proteome) のレベルにですセルのすべての遺伝子の調査、またはティッシュは」。

ゲノミクスはフレッド Sanger によって彼が最初にウイルスおよび mitochondrion の完全なゲノムを配列したときに確立されました。 マップしていたり、データ記憶および bioinformatic 分析彼のグループは配列、ゲノムの技術を 1970 80 年代に確立しました。

ゲノミクスの主要な枝はまださまざまな有機体のゲノムの配列にかかわっていますが、完全なゲノムの知識は主にさまざまな状態の間に遺伝子発現のパターンにかかわっている機能ゲノミクスのフィールドのための可能性を、作成しました。

ここの最も重要なツールはマイクロアレイおよび生物情報学です。 セルタイプまたはティッシュの蛋白質のフルセットの調査、およびさまざまな状態の間の変更は、 proteomics と呼出されます。

関連の概念は生物的材料の物質的な特性の調査 (例えば階層的な蛋白質構造および材料、鉱化された生物的ティッシュ、等) およびマクロスコピック機能に対する効果および物質科学のアプローチによる多重スケールの生物的文脈、リンクプロセス、構造および特性の障害と定義される materiomics です。

実際のターム 「ゲノミクス」は 1986 年にヒトゲノムのマップのメリーランドで催される会議で先生によってトムローダリック、ジャクソンの実験室 (棒港、私) の遺伝学者鋳造されると考えられます。

1972 年に、ウォルター Fiers およびゲント (ゲント、ベルギー) の大学の分子生物学の実験室の彼のチームは遺伝子のシーケンスを定める第 1 でした: バクテリオファージ MS2 のコート蛋白質のための遺伝子。 1976 年に、チームはバクテリオファージ MS2-RNA の完全なヌクレオチドシーケンスを定めました。 完全に配列されるべき最初の DNA ベースのゲノムはバクテリオファージΦ-X174 のそれでした; (5,368 bp)、 1977 年にフレデリック・サンガーが配列する。

配列されるべき最初の自由生存有機体は 1995 年に 「インフルエンザ菌」のそれであり、それ以来ゲノムは早いペースで配列されています。

2007 年 9 月現在で、完全なシーケンスは半分について菌類がある約 1879 匹のウイルス、 577 の細菌種および大体 23 の真核生物の有機体の知られていました。

ゲノムが完全に配列された細菌のほとんどは 「インフルエンザ菌」のような問題となる病気引き起すエージェント、です。 他の配列された種の、彼らが十分調査されたモデル有機体またはよいモデルになると約束されてだったので最も選択されました。 ミバエ 「ショウジョウバエずっと melanogaster」の非常に重要なツールであるが、イースト (「Saccharomyces Cerevisiae」) は長くずっと eukaryotic セルのための重要なモデル有機体です (特に早い前分子遺伝学で)。 ワーム 「Caenorhabditis elegans」の多細胞生物のための頻繁に使用される簡単なモデルです。 zebrafish 「Brachydanio rerio」の分子レベルの多くの進化の調査のために使用され、花 「Arabidopsis thaliana」の顕花植物のためのモデル有機体です。 日本の pufferfish (「Takifugu rubripes」の) および斑点を付けられた緑の pufferfish (「Tetraodon nigroviridis」の) はほとんどの種と比較される少しだけ非コーディング DNA を含んでいる彼らの小さく、コンパクトなゲノムのために興味深いです。

ヒトゲノムの草稿は早い 2001 年にヒトゲノムプロジェクトによって完了しま、多くのファンファーレを作成します。 2007 によって人間シーケンスは 「終了する」宣言されました (10,000 のベースおよびすべての染色体の 1 つ以下のエラーはアセンブルしました。 プロジェクトの結果の表示は重要な生物情報学のリソースを必要としました。 人間の参照アセンブリのシーケンスは UCSC のゲノムのブラウザを使用して探索することができます。


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