Genomik är studiet av genomet av organismer. Fältet innehåller den intensiva ansträngningar för att fastställa hela DNA-sekvensen av organismer och finskaliga genetisk kartläggning ansträngningar.
Fältet innehåller också studier av intragenomic fenomen såsom heterosis, epistasis, pleiotropy och andra interaktioner mellan lokus och alleler inom genomet. Däremot undersökningen av roller och funktioner av enstaka gener är primära fokus molekylärbiologi och genetik och är ett gemensamt ämne av moderna medicinska och biologiska forskningen. Forskning av enstaka gener inte hamnar i definitionen av genomik om syftet med detta genetiska, utbildningsavsnitt och funktionell information analys är att klarlägga dess effekt på, och svar på det hela genomet nätverk.
För United States Environmental Protection Agency omfattar"begreppet"genomik"ett större område av vetenskaplig undersökning associerade teknik än när genomik ursprungligen ansågs. En genomet är summan totalt av alla en enskilda organisms gener. Således är genomik studiet av alla gener i en cell eller vävnad, DNA (genotyp), mRNA (transcriptome), eller i protein (proteome) nivåer.
Genomik inrättades genom Fred Sanger när han först sekvenserade komplett genom ett virus och en mitokondrier. Hans grupp etablerade tekniker med sekvensering, mappning av genomet, datalagring och bioinformatik analyser i 1970-1980-talet.
En stor gren av genomik handlar fortfarande sequencing genomer av olika organismer, men kunskapen om hela genomet har skapat möjligheten för fältet i Funktionsgenomik, främst berörda med mönster av genuttryck under olika förhållanden.
De viktigaste verktyg här är microarrays och bioinformatik. Studie av en fullständig uppsättning proteiner i en celltyp eller vävnad och ändringarna under olika förhållanden, kallas proteomik.
Ett närliggande begrepp är materiomics, som definieras som studiet av materialegenskaper biologiska material (t.ex. hierarkiska protein strukturer och material, mineraliserade biologiska vävnader, etc.) och deras inverkan på makroskopiska funktion och fel i deras biologiska sammanhang, knyta samman processer, struktur och egenskaper vid flera skalor genom en Materialvetenskap strategi.
Själva begreppet "genomik" tros ha varit myntades av Dr. Tom Roderick, en genetiker vid Jackson Laboratory (Bar Harbor, ME) vid ett möte som hölls i Maryland på kartläggningen av det mänskliga genomet 1986.
1972, Walter Fiers och hans team vid Laboratory of Molecular Biology av vid universitetet i Gent (Ghent, Belgien) var de första som bestämmer vilken sekvens av en gen: genen för Bakteriofag MS2 coat protein. I 1976 fastställda laget av fullständig nukleotidsekvensen för Bakteriofag MS2-RNA. Det första DNA-baserade genomet att vara sekvenserade i sin helhet var Bakteriofag Φ-X 174; (5,368 bp), ordnat av Frederick Sanger 1977.
Den första viltlevande organismen och vara sekvenserade var ''Haemophilus influenzae'' 1995 och sedan sedan genom är att sekvenserade i snabb takt.
I September 2007, var hela meddelandesekvens känd från omkring 1879 virus, 577 bakteriearter och ungefär 23 eukaryoter organismer, varav ungefär hälften är svampar.
De flesta av bakterierna vars genomer har varit helt sekvenserade är problematisk sjukdomsframkallande ämnen, såsom ''Haemophilus influenzae''. Av andra ordnat arter valdes de flesta eftersom de var väl modellorganismer eller lovat att bli bra modeller. Jäst (''Saccharomyces cerevisiae'') har länge varit en viktig modell organism för de eukaryota cellen, medan fruktflugor ''Drosophila melanogaster'' har varit ett mycket viktigt redskap (särskilt i tidiga pre-molecular genetik). Masken ''Caenorhabditis elegans'' är en ofta Använd enkel modell för flercellig organismer. SEBRAFISK ''Brachydanio rerio'' används för många utvecklingsmässiga studier på molekylär nivå och blomman ''Arabidopsis thaliana'' är en modell organism för gömfröväxter. Den japanska blåsfisk (''Takifugu rubripes'') och fläckig gröna blåsfisk (''Tetraodon nigroviridis'') är intressant på grund av deras små och komprimera genomer, som innehåller mycket lite icke-kodande DNA jämfört med de flesta arter.
Ett utkast av det mänskliga genomet slutfördes av Human Genome Project i början av 2001, skapa mycket fanfar. Av 2007 förklarades mänskliga sekvensen "färdiga" (mindre än ett fel i 10 000 baser och alla kromosomer monteras. Visa resultaten av projektet krävs betydande bioinformatik resurser. Sekvensen av mänskliga referens församlingen kan utforskas med UCSC Genome Browser.
Denna artikel är licensierade under Creative Commons Attribution-ShareAlike License. Det använder sig av material från Wikipedia artikel om "genomik" allt material anpassat används från Wikipedia är tillgängliga enligt Creative Commons Attribution-ShareAlike License. Wikipedia ® själv är ett registrerat varumärke som tillhör Wikimedia Foundation, Inc.