5-羟色胺是单胺类神经递质，主要是在 (GI) 胃肠道和中枢神经系统 (CNS)。
大约 80%的人体内的总 5-羟色胺位于嗜铬细胞的肠道，它用于调节肠道运动。
其余部分合成的中枢神经系统有多种功能，包括情绪、 食欲、 睡眠、 肌肉的收缩，规管和一些认知功能，包括内存 serotonergic 神经元和学习 ；和血液中血小板，从而调节止血和血液凝固。
在人类和动物，5-羟色胺也见于真菌与植物。
5-羟色胺的单细胞生物多样性的用于各种目的。选择性五羟色胺再摄取抑制剂 (药物 SSRIs) 已被认定为有毒藻类。胃肠道寄生虫溶组织内阿米巴分泌血清素，有些病人造成持续分泌腹泻。
溶组织内阿米巴感染的病人已经发现高度升高血清 5-羟色胺水平的返回到正常的以下决议的感染。溶组织内阿米巴' 也响应 5-羟色胺的存在的变得更强。
5-羟色胺最初发现在 1935 年罗马意大利维托里奥 Erspamer 和美国的科学家在 1940 年代末。孤立和 1948 年评为莫里斯 · M.融洽的关系、 阿尔达绿色和克利夫兰诊所的欧文页，名称五羟色胺有点不恰当，反映了这一化合物的发现的情况。最初发现血清 — — 因此收缩物质作为五羟色胺、 影响血管音血清代理。此代理后化学被确定为 5-羟色胺 （5-HT） 的融洽的关系，以及广泛的生理作用阐明，5-羟色胺成为首选药理字段中的名称。
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