Gli Scienziati al Dipartimento Per L'Energia di Stati Uniti il Laboratorio Nazionale del Brookhaven Stanno proponendo di utilizzare un supercomputer originalmente sviluppato per simulare le particelle elementari in fisica delle alte energie per contribuire a determinare le strutture e le funzioni delle proteine, compreso, per esempio, le 30.000 circa proteine codificate dal genoma umano. Le informazioni Strutturali aiuteranno meglio gli scienziati a capire ruolo delle proteine' nella malattia e nella salubrità e possono piombo ai nuovi agenti diagnostici e terapeutici.
A Differenza degli esboscatori universali paralleli tipici, i 10.000 esboscatori universali in questo supercomputer (chiamato Cromodinamica Quantistica su un Chip, o QCDOC, per la sua applicazione originale nella fisica) ciascuno contengono la loro propria memoria e l'equivalente delle 24 superstrade della corsia per la comunicazione tra loro in sei dimensioni. Questa configurazione permette che il supercomputer rompa il compito di decifrare la disposizione tridimensionale degli atomi di una proteina - 100.000 in una proteina tipica - nei più piccoli bei pezzi di 10 atomi per esboscatore universale. Lavorando insieme, i chip efficacemente hanno tagliato il tempo di calcolo necessario per risolvere la struttura di una proteina da un fattore di 1000, dice James Davenport, un fisico a Brookhaven. Ciò diminuirebbe il momento per una simulazione a partire da circa 20 anni - 1 settimana.
“Il computer analizza le forze dell'attrazione e della repulsione fra gli atomi, secondo le loro posizioni, distanze ed angoli. Mescola con tutte le disposizioni possibili per arrivare al massimo configurazione tridimensionale stabile,„ Davenport dice.