Naukowowie przy Usa działem energii Brookhaven narodowe laboratorium proponują używać superkomputer oryginalnie rozwijać symulować podstawowe cząsteczki w wysokoenergetycznym physics pomagać ustalać funkcje proteiny i struktury, wliczając, na przykład 30.000 protein szyfrujących ludzkim genomem lub więc. Formalnie informacja pomaga naukowów lepiej rozumieć proteiny rola w, może prowadzić, i nowy diagnostyk i leczniczy agenci. chorobie i zdrowie
W przeciwieństwie do typowych równoległych procesorów, each zawierają ich swój pamięć i odpowiednika 24 pasa ruchu superhighway dla komunikować z jeden inny w sześć wymiarach. 10.000 procesorów w ten superkomputerze lub QCDOC (nazwany Kwant Chromodynamics na układzie scalonym, dla swój oryginalnego zastosowania w physics) Ten konfiguracja pozwoli superkomputer łamać zadanie odcyfrowywać trójwymiarowego przygotowania proteiny atomy w małych kawały 10 atomów na procesor. - 100.000 w typowej proteinie - Pracujący wpólnie układy scaleni efektywnie ciący oblicza czas potrzebny czynnikiem 1000 rozwiązywać proteiny strukturę, mówją James Davenport, fizyk przy Brookhaven. To zmniejszał czas dla symulaci od w przybliżeniu 20 rok, 1 tygodnia.
"komputer analizuje siły przyciąganie i odpychanie między atomami, w zależności od pozycj, odległości i kątów ich. Ja człapie przez wszystkie ewentualnych przygotowań przyjeżdżać przy najwięcej niewywrotnej trójwymiarowej konfiguraci," Davenport mówi.