Forskare på U.S.-Avdelningen av Energis den Brookhaven Medborgare som Laboratoriumet föreslår att använda en supercomputer som framkallas ursprungligen för att simulera elementarpartiklar i kick-energi fysik för att hjälpa att bestämma, strukturerar och fungerar av proteiner, inklusive, till exempel, de 30.000 eller så proteinerna kodade av människagenom. Strukturell information ska förstår kan vård- hjälpforskare som är bättre, protein roll i sjukdom och och leda till nya diagnostiska och terapeutiska medel.
I Motsats Till typiska parallella processorer innehåller de 10.000 processorerna i denna supercomputer (som kallas Quantum Chromodynamics på en Gå i flisor eller QCDOC, för dess original- applikation i fysik) varje deras egna minne, och motsvarigheten av en 24 lanesuperhighway för att meddela med en another i sex dimensionerar. Denna konfiguration låter supercomputeren bryta uppgiften av att dechiffrera den tredimensionella ordningen av ett protein atoms - 100.000 i ett typisk protein - in i mindre en stor bit av 10 atoms per processor. Arbetet tillsammans, gå i flisor effektivt snittet den beräknande tiden som behövs för att lösa ett protein, strukturerar vid en dela upp i faktorer av 1000, något att säga James Davenport, en fysiker på Brookhaven. Skulle Detta förminskar tiden för en simulering från ungefärligt 20 år till 1 vecka.
”Analyserar datoren styrkorna av dragningen och avskyn mellan atoms, beroende av deras placerar, distanserar och metar. Den hasar till och med alla möjlighetordningar för att ankomma på den mest stabila tredimensionella konfigurationen,” Davenport något att säga.