3 столетия после того как pioneering Голландский microbiologist сперва наблюдал спирал-форменным устным denticola Treponema патогена, научные работники расшифровывали последовательность ДНА бактерии всю и использовали сравнительную геномику для того чтобы бросить новый свет на других микробах spirochete.
Изучение научными работниками на Институте для Genomic Исследования (TIGR) и сотрудницах на Коллеже Baylor Медицины и Центре Науки Здоровья Техасского Университета на Хьюстоне нашло глубокомысленные разницы между содержанием гена denticola T., которое связано с периодонтальным заболеванием (камеди), и других spirochetes которые причиняют сифилиз и заболевание Lyme.
«Это выделяет силу сравнительной геномики помочь нам понять как родственные патогены могут причинить заболевания совершенно другой,» говорит Ян Paulsen, которое вело sequencing вместе с товарищеским исследователем Rekha Seshadri TIGR. Paulsen говорит что геном denticola T. «обеспечивает превосходный пункт справки для того чтобы изучить биологию spirochetes.»
Исследователя нашли что denticola T. имеет больше чем дважды так много генов как spirochete которое причиняет сифилиз, T. pallidum, и т там фактически никакая консервация заказа гена (synteny) между геномами 2 отнесенных микробов. Авторы говорят которое показывает что расхождение 2 spirochetes' от общей родоначальница «был стародедовским случаем» в отличие от более недавнего расхождения много других групп в составе бактерии от их родовых родственников.
Ожидано, что помогает изучение генома научным работникам узнать больше о как устные патогены взаимодействуют в зубоврачебной металлической пластинке для того чтобы причинить заболевание камеди. Denticola T. клонит суммировать в такой subgingival металлической пластинке с gingivalis Porphyromonas, бактерии которую связывают с periodontitis, заболевании камеди которое влияет на оцененных 200 миллионов Американцов. Иметь полные геномы обоих микробов поможет исследует изучение их взаимодействия и по возможности обеспечивает молекулярные ключи для того чтобы найти цели для снадобиь для того чтобы обработать заболевание камеди.
Научные работники и сотрудницы TIGR sequenced геном gingivalis P. в прошлом году и теперь расшифровывают геномы 6 других бактерий устн-полости и дирижируют «мета-genomic» assay микробов рта. оцененных 500 микробных видов в людском рте, только около 150 видов были выращиваны в питательной среде: в лабораториях.
«Последовательность генома показывает механизмы используемые denticola T. для того чтобы колонизировать и выдержать в сложной окружающей среде устных biofilms,» говорит Seshadri, автор изучения первый. Сотрудницы TIGR в изучении PNAS включили Steven J. Norris на Центре Науки Здоровья UT на Хьюстоне и Джордж M. Weinstock на Коллеже Baylor Отдела Медицины Молекулярной и Людской Генетики.
В бумаге PNAS, исследователя сообщили что геном denticola T. «отражает свои приспособления для колонизации и выживания» с другими бактериями в металлической пластинке. Сравнено к другому spirochetes (включая оцененный 60 других treponomal видов или phylotypes найденные в зубоврачебной металлической пластинке), denticola T. относительно легко для того чтобы культивировать и манипулировать genetically, делающ им превосходную модель для исследования spirochete.
Spirochetes выдающийся их спиральн формами и их способностью corkscrew их путь через гелеподобные ткани, причиняя несколько различных заболеваний. Отец микробиологии, Antonie фургон Leeuwenhoek, сперва сделал эскиз к устному spirochete - более последнему названному denticola T. - после осматривать его через его примитивный микроскоп в 1670s. Даже после 3 столетий, однако, понимают spirochetes бедно в отличие от много других главных типов бактерий.