Published on March 29, 2004 at 8:11 AM
三个世纪,在一位作早期工作在的荷兰语微生物学家首先观察了螺旋型口头病原生物密螺旋体 denticola 后,科学家解密细菌的整个脱氧核糖核酸顺序并且使用了比较染色体组的投下在其他 spirochete 微生物的新的光。
由科学家的研究基因组研究 (TIGR) 医学 Baylor 学院和得克萨斯大学的学院和合作者的健康科学中心在休斯敦查找了 T. denticola 基因目录的深刻区别,与牙周 (胶) 疾病相关导致梅毒和莱姆关节炎疾病的和其他螺旋菌之间。
“这显示比较染色体组的功率帮助我们知道相关病原生物如何能导致完全不同的疾病”,说伊恩 Paulsen,导致排序以及 TIGR 研究员 Rekha Seshadri。 Paulsen 说 T. denticola 染色体 “提供一个非常好的参考点学习螺旋菌生物”。
研究员发现 T. denticola 有更多比两次许多个基因作为导致梅毒的 spirochete,苍白球的 T.,和该那里实际上没有基因秩序的守恒 (synteny) 在二涉及的微生物的染色体之间。 作者说表明从一个公用祖先的二螺旋菌’分歧 “是一个古老活动”与许多其他组对比的最近分歧从他们的祖先亲戚的细菌。
染色体研究预计帮助科学家发现更多关于口头病原生物如何在牙菌斑配合导致牙龈炎。 T. denticola 在与 Porphyromonas gingivalis 的这样 subgingival 匾,与 periodontitis 相关的细菌,影响估计 200 百万个美国人的牙龈炎倾向于综合。 有两微生物完全染色体将帮助研究研究他们的交往和可能提供分子线索查找药物的目标对待牙龈炎。
TIGR 科学家和合作者去年排序 P. gingivalis 染色体和现在解密其他六口头洞细菌染色体并且执行嘴微生物 “阶基因组”检验。 在人力嘴的估计的 500 个微生物种类,仅大约 150 个种类在实验室被开化了。
“染色体顺序显示 T. denticola 用于的结构拓殖,并且生存在口头生物薄膜的复杂环境里”,研究的第一个作者说 Seshadri。 TIGR 的合作者在 PNAS 研究中包括史蒂文 J. Norris 在 UT 健康科学中心在休斯敦和乔治 M. Weinstock 在分子和人类遗传学的医学的部门 Baylor 学院。
在 PNAS 文件,研究员报告 T. denticola 染色体 “反射其殖民化和生存的适应”与在匾的其他细菌。 与其他螺旋菌比较 (在牙菌斑或 phylotypes 找到的包括估计 60 个其他 treponomal 种类), T. denticola 是相对地容易培养和操作基因上,做它 spirochete 研究的一个非常好的设计。
螺旋菌由他们的螺旋形状和他们的能力通过胶般组织螺旋式前进他们的方式区分,导致一定数量不同的疾病。 微生物学的父亲, Antonie van Leeuwenhoek,在查看它以后首先速写了一口头 spirochete - 最新名为 T. denticola - 通过他的原始显微镜在 17 世纪 70 年代。 在三个世纪以后,然而,螺旋菌是很难懂与细菌对比的许多其他主要类型。
到目前为止, TIGR 排序三螺旋菌完全染色体: T. denticola; 苍白球的 T.,导致梅毒; 并且 Borellia burgdorferei,导致莱姆关节炎疾病。 第四 spirochete,螺旋体 interrogans 的染色体,导致这个疾病 Leptosporisis,排序在中国国家人类基因组中心。
TIGR 的比较分析发现大约半 T. denticola 的 2,786 个基因不是存在其他三排序的螺旋菌。 全部四螺旋菌有共同兴趣的 618 个基因包括在微生物的其他类型没有被找到排序染色体的有些基因。
“有几螺旋菌染色体顺序提供一个卓越的机会学习演变”, Norris 说,说所有螺旋菌是表兄弟,即使他们在各种各样的环境居住,包括泥、蛤蜊、白蚁胆量、滴答声和人。 通过比较更多螺旋菌脱氧核糖核酸顺序,他说, “我们可能能获取什么的根任意做细菌原因疾病,活在这个环境里,甚至对其主机是有利的”。
克莱尔 M. Fraser, TIGR 的总统,说顺序数据 “为测试可能解释的分子区别提供一个新的起点”为什么和如何 T. denticola 和 T. 苍白球原因这样不同的疾病: “塑造了这些染色体的此研究显示了新的答案到 spirochete 特定生物以及演变强制”。
基因组研究 (TIGR) 学院是在洛克维尔根据的一个非营利的研究所,马里兰。 TIGR,在 1995年排序一个自由居住的有机体第一条完全染色体,在基因组革命的最前方,自从这所学院在 1992年被创办了。 TIGR 开展介入对染色体和基因产品的结构上,功能和比较分析的研究在病毒、细菌、 archaea 和真核。
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