Tre århundraden efter en banbrytande Holländsk microbiologist observerade först denformade muntliga pathogenTreponemadenticolaen, har forskare dechiffrerat bakterie hela DNA ordnar och använde jämförbar genomics för att cast nytt lätt på andra spirochetemicrobes.
Studien av forskare på Institutet för Genomic Forskning (TIGR) och kollaboratörer på den Baylor Högskolan av Medicinen och den Vård- Vetenskapen för Texasuniversitetet Centrerar på Houston grundar djupsinniga skillnader mellan genen som är nöjd av den T-. denticolaen, som är tillhörande med den tandrot- sjukdomen (för gummi), och av andra spirochetes som orsakar syphilis och den Lyme sjukdomen.
”Markerar Detta driva av jämförbar genomics för att hjälpa oss att förstå, hur släkta pathogens kan orsaka fullständigt olika sjukdomar,” något att säga Ian Paulsen, som ledde ordnande i viss följd tillsammans med den med- TIGR-forskare Rekha Seshadri. Paulsen något att säga som den T-. denticolagenom ”ger ett utmärkt, pekar av hänvisar till till studien biologin av spirochetesen.”,
Forskarna som finnas, att den T-. denticolaen har mer, så många gener som spirocheten, som orsakar syphilis, pallidum T., och som där är faktiskt inget beskydd av genen, beställer än två gånger (synteny) mellan genom av de två släkta microbesna. Författarenågot att säga som indikerar att divergensen för de två spirochetesna' från en allmänningförfader ”var en forntida händelse” i kontrast till den nyare divergensen av många andra grupper av bakterier från deras släkt- släktingar.
Genomstudien förväntas att hjälpa forskare att finna ut mer om hur muntliga pathogens påverkar varandra i tand- platta för att orsaka gummisjukdomen. Den T-. denticolaen ansar för att samla i sådan subgingival platta med Porphyromonas gingivalis, en bakterie, som är tillhörande med tandlossning, en gummisjukdom som påverkar beräknade 200 miljon Amerikaner. Ha de färdiga genom av studien för båda den microbes ska hjälpforskningar ger deras växelverkan och eventuellt molekylära ledtrådar för att finna uppsätta som mål för droger till festgummisjukdomen.
TIGR-forskare och kollaboratörer ordnade genom av P.-gingivalis i fjol och nu dechiffrerar genom av sex andra muntlig-hål bakterier och förar ”engenomic” analys av munmicrobes. Av den beräknade 500 mikrobiella arten i människamunnen har endast omkring 150 art odlats i laboratorium.
”Ordnar genom avslöjer mekanism som används av T-. denticola för att kolonisera, och att fortleva i den komplexa miljön av muntliga biofilms,” varar upphovsman till något att säga Seshadri, studien först. TIGRS kollaboratörer i PNAS-studien inklusive Steven J. Norris på den Vård- Vetenskapen för UT Centrerar på Houston och George M. Weinstock på den Baylor Högskolan av Medicin Avdelning av Molekylära och MänniskaGenetik.
I PNASEN skyla över brister, anmälde forskare att genom av den T-. denticolaen ”reflekterar dess anpassningar för colonization och överlevnad” med andra bakterier i platta. Jämfört till annan spirochetes (däribland beräknade 60 andra treponomal art eller phylotypes som finnas i tand- platta), är den T-. denticolaen förhållandevis lätt att odla och att behandla genetiskt, danande det som ett utmärkt modellerar för spirocheteforskning.