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Protein-Sequenzen schwieriger vorherzusagen als ursprünglich angenommen

Published on April 12, 2004 at 11:08 PM · No Comments

Wissenschaftler haben seit Jahrzehnten, dass die Sequenzierung des menschlichen Genoms automatisch ergeben würden die Sequenzen von Proteinen, die funktionelle Produkte von Genen glaubte, und damit die Entschlüsselung der Mechanismen hinter der menschlichen Zelle Biologie und Krankheit führen. Allerdings, ein Papier in Science veröffentlicht heute von der Ludwig Institute for Cancer Research (LICR) beschreibt eine neue zelluläre Prozess, der einige Zweifel an der akzeptierten Paradigma der Ableitung eines Proteins Sequenz aus der DNA-Sequenz der Gene.

Wenn ein Protein ist aufgerufen, in einem zellulären Prozess handeln, sind die Segmente (Exons) des Gens der DNA in RNA-Fragmente, die dann gespleißt (verbunden) werden nach den Anweisungen von der DNA kodiert transkribiert. Die RNA-Transkript wird dann in Aminosäuren, die ein Protein bilden übersetzt. Wenn das Protein nicht mehr durch die Zelle benötigt, ist es abgebaut durch einen spezialisierten komplexer als "Proteasom". Obwohl funktionell verschiedene Proteine ​​von einer Gensequenz erzeugt werden kann - durch die Modifikation durch die Zugabe von kleinen Molekülen, die Aminosäuren, durch Verkürzung der Sequenz, oder durch die Übersetzung der RNA-Transkripte, dass einige Exons weglassen - sie sind Variationen über ein Thema bestimmt im Wesentlichen durch das Gen der DNA-Sequenz. Doch Wissenschaftler des LICR Niederlassung in Brüssel, Belgien, haben nun gezeigt, dass die Reihenfolge der ein menschliches Protein tatsächlich durch das Proteasom in einer Weise, die völlig von der Gensequenz sind unvorhergesehene verändert werden. Die Entdeckung ist sowohl ein neues Verfahren zur Protein-Verarbeitung und ein neuartiges, bisher ungeahnte Rolle für das Proteasom.

'Post-translationale Spleißen "wurde entdeckt, als die LICR Team analysierte kleinen Protein-Sequenzen, die das Immunsystem aktivieren in Reaktion auf die Anwesenheit von Krebszellen. Diese "Peptid-Antigene" werden erstellt, wenn das Proteasom Fragmente eine Krebs-spezifische Protein in Peptide, die dann an die Zelloberfläche transportiert werden, um die Zelle für die immunologische Zerstörung markieren. Das Team fand heraus, dass ein Peptid-Antigen, die das Immunsystem erkennen und zerstören Melanomzellen stimuliert, eine Sequenz ganz anders, das durch seine Gensequenz vorausgesagt hatte. Bei weiteren Untersuchungen fanden die Forscher heraus, dass das Proteasom hatte ein Peptid in drei geschnitten und war dann wieder in die Stücke so, dass das Peptid-Antigen nun durch das Immunsystem erkannt fehlte ein Teil der ursprünglichen Sequenz.