Menggunakan teknologi konvensional, peneliti didukung oleh National Cancer Institute (Aplikasi Ilmu International Corporation-Frederick, Inc (SAIC)) telah mengembangkan metode baru untuk mengidentifikasi protein yang ditemukan dalam jumlah jejak dalam darah. Metode ini menawarkan harapan untuk mendeteksi jumlah kecil dari molekul darah-ditanggung bahwa sinyal adanya penyakit tertentu, seperti kanker, penyakit menular, gangguan perilaku, cacat perkembangan, dan penyakit neurodegenerative. Molekul mungkin biomarker berguna untuk membantu dalam deteksi dini dan pengobatan ovarium, payudara, dan kanker prostat. National Cancer Institute (NCI) adalah bagian dari Institut Kesehatan Nasional (NIH) dan lembaga utama pemerintah untuk penelitian kanker.
Bekerja di Laboratorium Proteomika dan Teknologi Analitik di NCI-Frederick, Md, para peneliti menciptakan sebuah prosedur multi-langkah untuk memisahkan protein darah yang berasal dari serum, yang merupakan cairan, jelas kekuningan yang memisahkan keluar dari darah setelah pembekuan dan tidak berisi sel. Bersama-sama, semua protein yang dikenal sebagai proteome serum. Sebelum upaya untuk mengidentifikasi protein rendah kelimpahan yang tidak berhasil terutama karena langkah-langkah untuk mengurangi pemisahan jumlah besar, tinggi kelimpahan protein menyebabkan kerugian secara simultan, kecil rendah kelimpahan protein. Pemisahan dan fraksinasi diperlukan untuk menghasilkan sampel yang dapat dianalisis dengan spektrometri massa, sebuah teknik tinggi-throughput untuk mengidentifikasi protein individu.
Untuk mengatasi masalah ini, para peneliti melakukan serangkaian fractionations pada volume kecil serum sekitar 0,04 sendok teh. Langkah-langkah termasuk beberapa metode yang berbeda pemisahan, disebut kromatografi fokus dan isoelektrik, yang didasarkan pada ukuran, muatan listrik, dan sifat kimia lainnya yang berbeda antara protein. Sampel ini kemudian disuntikkan ke spektrometer massa untuk memperoleh data sekuens mentah yang kemudian dikaitkan dengan database proteomika manusia untuk mengidentifikasi molekul yang diamati.