CSIRO statistiker har utvecklat ett nytt sätt att subtyp barn akut lymfatisk leukemi (ALL), den vanligaste formen av cancer hos barn under 12.
CSIRO: s nya molekylära klassificerare är validerad på kliniska prover av Barnens Cancer Institute Australien för medicinsk forskning (CCIA).
"Noggrann klassificering av alla i dess olika subtyper är avgörande för effektiv behandling av denna sjukdom", säger docent Murray Norris, biträdande direktör för CCIA. "Vi är mycket glada att få arbeta med CSIRO att utvärdera deras klassificerare."
"Vi använde genen uppgifter uttryck microarray från alla patienter för att utveckla vår klassificerare," säger Dr David Mitchell CSIRO Matematiska och informationsvetenskap. "Vi har utvecklat flera egna statistiska metoder som gör det möjligt för oss att använda denna typ av data för att utveckla enklare och mer kostnadseffektivt diagnostiska tester."
"Dessa nya kraftfulla statistiska metoder har gjort det möjligt för oss att utveckla en klassificerare för subtypning alla som bara använder nio gener, medan mindre statistiska tekniker resultera i klassificerare som använder tiotals eller hundratals gener", säger Dr Mitchell. "Ju färre gener som krävs för att diagnostisera en sjukdom, kan den enklare de diagnostiska testerna vara."
Tillgång till enkel teknik för noggrann subtypning av ALLA skulle kunna öka andelen botade i utvecklingsländer från den nuvarande nivån på ca 30% att de utvecklade länderna, cirka 80%.
Dessutom, som nuvarande typningsmetoder innebär direkt undersökning av benmärgen biopsier, CSIRO forskare planerar att utveckla en klassificerare som bara kräver ett blodprov, inte en benmärgsbiopsi.