Rutgers forskare har dechiffrerat de komplexa mekanikerna av microcinen J25 (MccJ25), en mycket liten naturlig molekyl som agerar något liknande en korka i en buteljera till kvarteret ett nyckel- bakterie- enzym - som potentiellt är ledande till en ny utveckling av antibiotikummar.
Två lag av forskare på Rutgers, Delstatsuniversiteten av Nytt - jersey som självständigt upptäcks att unikt kvarter MccJ25 ”en tunnel” in i det bakterie- enzymet, RNApolymerase (RNAP). ”Tunnelen” är van vid kommer med rå material för RNAsyntes in i enzymet och att driva ut byproducts av RNAsyntes.
”Bokslut det fullsatt, svälter den tvåvägs”tunnelen” RNAP, stänger den besegrar, och bytar bakterierna,”, sade Richard H. Ebright, Howard Hughes en Medicinsk Institututredare, och en professor i Rutgerss avdelning av kemi och kemisk biologi och det Waksman Institutet av Microbiology. ”Planlägger Överenskommelse långt in, som MccJ25 fungerar uppsättningar arrangera för utvecklingen av den nya antibacterial drogen.”,
Att att förstå, hur MccJ25 fungerar, Ebrights grupp använda genetiska metoder som testar hundratusentals RNAP-derivata eller variants, för att definiera bandplatserna för MccJ25 på RNAP. Forskarna använde också biophysical metoder, märker att fästa som är fluorescerande, till MccJ25 och till varje av platser för ett dussin i RNAP. Att Använda märker, forskarna mått placera av varje som är destinerat, parar i ettnågot liknande sätt som verifierar resultaten av det genetiska arbetet. De använde därefter biochemical metoder för att finna ut vad händde en gång röror MccJ25 till RNAPEN.
Forskninglaget av Konstantin Severinov, en förbunden professor i Rutgerss avdelning av molekylär biologi och biochemistry och det Waksman Institutet, hade varit första som visar att RNAP från celler som var resistent till MccJ25 visade också motstånd till drogen i ett provrör. I deras strömarbete använde dessa forskare biochemical metoder för att karakterisera, i molekylärt specificerar, mekanismen av handlingen MccJ25. I tillägg använde gruppen sofistikerade biophysical metoder som avslöjde hur röror MccJ25 till en molekyl för singel som RNAP ögonblickligen stoppar den.
I Juni 18 utfärda av den Molekylära Cellen, Ebrighten och kollegorna för föra journal över, och Severinov och medlemmar av hans forskning team, beskriver i separata rapporter hur varje lag använde olika experimentella metoder för att ne de samma avslutningarna.
”Var Det endast i fjol, att vi löste strukturera av denna molekyl, precis 21 långa amino syror, anmärkningsvärt storleksanpassar båda i dess, och dess strukturera,”, sade Ebright, en deltagare i de original- strukturella studierna, tillsammans med Severinov.
”Har en store många legitimationshandlingar publicerats på denna molekyl i i fjol,” tillfogade Severinov. ”Intressera i MccJ25 har egentligen sprängt.”,
Den Formade något liknande en lasso med dess svan drog tillbaka till och med kretsa, är MccJ25 en av mycket bekant få molekylar som har denna högt stabila och styva konfiguration - ett kännetecken som kan leda till designen för applikationdet okändadrogen.
”Strukturerar robustt MccJ25 tillstånd det till motståndskraften som allt sorterar av hårt miljö- villkorar,”, sade Severinov. På grund av dess robusthet tillfogade han, ”Avdelningen [U.S.] av Försvar intresseras i molekylen som ett potentiellt bakterie- sanera medel.”,
MccJ25 förhindrar bakterie- RNAP och dödar bakterier, men den förhindrar inte människan RNAP och skulle därför inte byte en människa. Ebright varnar, emellertid, att MccJ25 har några ofullkomlighet. Den påverkar endast Escherichia Coli och nära släkt bakterie- art och är betvingar högt till framkallande motstånd.
http://www.rutgers.edu/