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得知蛋白质结构是特别与对待修改蛋白质功能的病症相关

Published on June 24, 2004 at 6:34 AM · No Comments

结构上的染色体组的域 - 蛋白质三维几何结构的研究 - 由巨大数额数据、消耗大的实验和笨重分析方法复杂化。

计算机科学教授布鲁斯 Randall 唐纳德和他的学员工作通过开发同时使实验减到最小的数量并且加速在确定蛋白质结构介入的数据分析的技术减轻此间接费用。

得知蛋白质结构是特别与对待修改蛋白质功能的病症相关,例如癌症。

发布在生物化子核磁共振 (核磁反应),唐纳德、一名研究生和博士后存在新的算法的日记帐的连续的月解释核磁共振的数据显示蛋白质的形状和分子结构。 核磁共振调查蛋白质的微小分子结构和的用途,分光镜生成几何评定网络的分度器和统治者。

“在这些文件,我们讨论考虑的一个新的结构如何解决这些问题,并且我们的算法是极为准确的”,附属教授说唐纳德、霍安 P. 和爱德华 J. 福莱 Jr. 1933 教授年计算机科学和化学和生物科学。

第一篇论文,发布在 2004年 6月,在现在是一位助理教授计算机科学在卡内基梅隆大学的唐纳德的实验室解释克里斯托弗 Langmead,博士生工作。 Langmead 的算法引入分配核磁共振的评定的新的技术到特定分子债券。 多数核磁共振的实验评定蛋白质,报告化学键之间分子和角度的距离,但是数据不指示哪些原子或结合评定对应。 “它是一点象采取大家的所有高度和重量在鸡尾酒会,但是您不知道哪个高度同行陪哪个人员”,说唐纳德。 Langmead 的和唐纳德的技术分配评定到正确的中坚力量,帮助揭幕蛋白质的结构。

由唐纳德和 Lincong Wang,达特矛斯博士后的第二篇论文,在 2004年 7月将被发表。 本文描述一个新的蛋白质结构确定算法,解决复杂代数等式与蛋白质的几何涉及实验数据。 “我们的算法要求较少数据,仍然发生的蛋白质结构是难以置信地准确的”,唐纳德说。 不同于早先技术, Wang 的等式可以正确地解决的有些类似于解决高中代数名望的二次方程。 Wang 和唐纳德希望他们的工作证明有用给两位结构上的基因组研究员以及对那些在更加清楚的结构上的生物域。

http://www.dartmouth.edu/