I Ricercatori al Dipartimento Per L'Energia di Stati Uniti il Laboratorio Nazionale del Argonne E l'Università di Chicago hanno determinato il sistema cristallino del sortase B, un enzima trovato nei batteri che causano lo stafilococco e l'antrace. Mentre un antibiotico è probabilmente di distanza cinque - sette anni, la struttura potrebbe fornire la prima bugna nello sviluppare un trattamento per le infezioni.
La ricerca è pubblicata oggi nella Struttura del giornale.
Ha richiesto ai ricercatori il 21 giorno per sviluppare il modello tridimensionale del sortase dal genoma. Senza la nuova tecnologia disponibile a Structural Biology Center di Argonne, compreso i Raggi X potenti della Sorgente Avanzata del Fotone per illuminare le strutture ed il Midwest Concentri per le Genomiche Strutturali robot e gli impianti di automazione per l'espressione, la depurazione e la cristallizzazione della proteina, il trattamento potrebbero richiedere parecchi mesi.
Analizzando i genoma, i ricercatori scoprono le informazioni che piombo a progettazione basata a struttura o “razionale„ della droga. Il problema è che i ricercatori non sanno che metà delle proteine codificate dal genoma faccia o lavorano.
Ora che i ricercatori capiscono l'enzima, sperano di trovare un modo fermarlo - o rallentarlo almeno giù. Sortase fissa le proteine alla superficie degli agenti patogeni batterici. Guida che di Queste proteine gli agenti patogeni sopravvivono a e che fioriscono.
I Batteri come stafilococco e l'antrace hanno bisogno del ferro di funzionare. Ma poco ferro libero è disponibile nella circolazione sanguigna perché la maggior parte è limitata in globuli rossi. Così i batteri sviluppano un meccanismo per sollevare aperto i globuli rossi e queste proteine li aiutano.
“Questo è realmente un meccanismo molto astuto,„ ha detto Andrzej Joachimiak, il ricercatore del cavo e Direttore di Structural Biology Center. Il trattamento è descritto in un articolo pubblicato l'anno scorso nella Scienza da Olaf Schneewind dell'Università di Chicago, che ha steso il fondamento per il progetto di sortase.
I batteri aprono il globulo, legano l'emoglobina che contiene il heme - il pigmento che contiene ferro in emoglobina - trasporta il heme, degrada il heme e poi estrae il ferro.
Prima Che la proteina possa legare l'emoglobina, deve essere fissata ad una posizione specifica sulla superficie della cella. I batteri usano un enzima specifico per compire questo; in questo caso è sortase.
“Sortase sarebbe un buon obiettivo per una droga, perché se una può bloccare l'enzima, non potrà da fissare queste proteine alla superficie ed i batteri non potrebbero ottenere il ferro dalla nostra circolazione sanguigna,„ Joachimiak ha detto.
La ricerca esamina più formalmente il sortase sia da stafilococco che antrace -, Staphylococcus aureus e Bacillus anthracis e conclude che i due sono simili. Entrambi hanno la stessa triade catalitica dell'amminoacido con Cys, residui presenti in entrambi gli enzimi - che di ASP e Suo significa che il sito della reazione della enzima-proteina è lo stesso. Soltanto la posizione di uno dei residui varia.