Argonne の国立研究所そしてシカゴ大学米国エネルギー省の研究者は sortase B のぶどう球菌および炭疽を引き起こす細菌で見つけられる酵素の結晶構造を定めました。 抗生物質がおそらく 5 から 7 年の離れている間、構造は伝染に処置の開発の最初の糸口を提供できます。
研究はジャーナル構造で今日出版されます。
研究者にゲノムからの sortase の三次元モデルを構築するために 21 日かかりました。 Argonne の構造を照らす高度の光子ソースの強力な X 線および米国中西部を含む構造生物学の中心で、使用できる新技術なしでロボティック構造ゲノミクスのために集中させれば蛋白質の表現、浄化および結晶化のためのオートメーション機能は、プロセス数月を取ったかもしれません。
ゲノムの分析によって、研究者は構造ベースか 「理性的な」薬剤デザインの原因となる情報の覆いを取ります。 問題はゲノムによってコードされる蛋白質どんな半分のするか、またはどのように働くか研究者が知らないことです。
研究者が酵素を理解するので、それを - 停止するか、または少なくとも遅らせる方法を見つけることを望みます。 Sortase は細菌の病原体の表面に蛋白質を接続します。 病原体が存続させ、活気づくこれらの蛋白質のヘルプ。
ぶどう球菌および炭疽のような細菌は鉄が作用することを必要とします。 しかし少し自由な鉄はほとんどが赤血球で区切られるので血のストリームで使用できます。 従って細菌は開いた赤血球をテコで動かすためにメカニズムを開発しこれらの蛋白質はそれらを助けます。
「これは実際に非常にスマートなメカニズムです」、 Andrzej Joachimiak、構造生物学の中心の鉛の研究者およびディレクターを言いました。 プロセスは sortase のプロジェクトの土台を築いたシカゴ大学のオラフ Schneewind が科学で去年出版する記事で輪郭を描かれます。
細菌は血球を、結合しますヘム - ヘモグロビンで鉄を含んでいる顔料 - を運び、ヘムを、低下させ、ヘムをそして得る鉄を含んでいるヘモグロビンを開きます。
蛋白質はヘモグロビンを結合できる前にセルの表面の特定の位置に接続しなければなりません。 細菌はこれを達成するのに特定の酵素を使用します; この場合それは sortase です。
「1 つが酵素を妨げることができればそれが表面にこれらの蛋白質を接続ことはできないし、細菌が私達の血流から鉄を得られなかったのでと Sortase 薬剤のためのよいターゲット」は Joachimiak 言いましたです。
研究はぶどう球菌からの sortase をおよび炭疽 -、黄色ブドウ球菌および両方炭疽菌より形式的に見、 2 つが類似していることを結論します。 両方とも両方の酵素で現在の彼のそして非対称多重処理システムの酵素蛋白質の反作用のサイトは同じであることを意味する Cys の同じ触媒作用のアミノ酸のトライアドが残余あります。 残余の 1 の位置だけ変わります。