Исследователя на Министерстве Энергетики США Лаборатория Argonne Национальная и Чикагский Университет определяли кристаллическую структуру sortase B, энзима найденного в бактериях которые причиняют staph и антракс. Пока антибиотик вероятно 5 до 7 лет отсутствующих, структура смогла обеспечить первый ключ в начинать обработку для инфекций.
Исследование опубликовано сегодня в Структуре журнала.
Оно принял исследователям 21 день для того чтобы построить пространственную модель sortase от генома. Без новой технологии доступной на Центре Биологии Argonne Структурном, включая Рентгеновские Снимки Предварительного Источника Фотона мощные для того чтобы осветить структуры и Midwest Центризуйте для Структурных Геномик робототехнических и средства автоматизации для выражения, очищения и кристаллизации протеина, процесс смогли принять несколько месяцев.
Путем анализировать геномы, исследователя расчехляют информацию которая ведет к структур-основанной или «рациональной» конструкции снадобья. Проблема что исследователя не умеют какую половину протеинов закодированных геномом сделайте или как они работают.
Теперь, когда исследователя понимают энзим, они надеются найти путь остановить его - или хотя бы замедлить его вниз. Sortase прикрепляет протеины к поверхности бактериальных патогенов. Помощь Этих протеинов патогены выдерживают и процветают.
Бактериям как staph и антракс нужно утюг действовать. Но меньший свободный утюг доступен в кровеносном русле потому что наибольшее из этого прыгнуто в клетках крови. Так бактерии начинают механизм для того чтобы pry открыто клетки крови, и эти протеины помогают им.
«Это фактически очень умный механизм,» сказал Andrzej Joachimiak, исследователя руководства и директор Структурного Центра Биологии. Процесс конспектирован в статье опубликованной в Науке в прошлом году Olaf Schneewind Чикагского Университета, который клал фундамент для проекта sortase.
Бактерии раскрывают клетку крови, связывают гемоглобин который содержит гем - пигмент содержа утюг в гемоглобине - транспортирует гем, ухудшает гем и после этого извлекает утюг.
Прежде Чем протеин может связать гемоглобин, он должен быть прикреплен к специфическому положению на поверхности клетки. Бактерии используют специфический энзим для выполнения этого; в этот случай это sortase.
«Sortase было бы хорошей целью для снадобья, потому что если одно может преградить энзим, то оно не будет прикрепить эти протеины к поверхности и бактерии не могли бы получить утюг от нашего кровотока,» Joachimiak сказало.
Исследование смотрит sortase и от staph и антракса - более официально, Золотистого Стафилококка, и Бациллы anthracis, и заключает что 2 подобно. Оба имеют такую же каталитическую тройчатку аминокислоты с Cys, выпарки присутствующие в обоих энзимах - которое Его и Asp значит что место реакции энзим-протеина это же. Только положение одной из выпарок меняет.