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计算机建模方法绘制的流感病毒的演变

Published on July 21, 2004 at 9:43 AM · No Comments

一个加州大学洛斯阿拉莫斯国家实验室工作的科学家与合作者从剑桥大学 (英国)和世界卫生组织国家流感中心在Erasmus医学中心 (荷兰鹿特丹)已经开发出一种计算机建模方法映射的进化流感病毒。

很快,该方法可以帮助世界各地的医学研究人员开发了一个更好地了解流感和其他病毒,使疾病逃避人体免疫系统的某些突变。

在当前版本的“科学”杂志上发表了一篇论文,描述他们从最初的引进工作量化和可视化的流感A型(H3N2)病毒的抗原性和遗传进化到人类在1968年从美国和欧洲的科学家团队到2003年。研究结果在地图上显示病毒演变作为一个系列11密切相关的病毒集群的,因为它试图逃避在过去几十年的人体免疫力。

流感病毒疫苗的开发和监测方案中所涉及的研究人员,并有可能如丙型肝炎和艾滋病毒以及其他病原体的映射方法将允许,量化和可视化这些病毒的演变。它可以帮助监测之间疫苗的抗原差异和循环病毒株,可以帮助量化接种疫苗的效果。该方法还提供了一个用于预测新出现的病毒株的相对感染成功的路线。

据洛斯阿拉莫斯国家实验室的计算生物学家艾伦Lapedes,“此次合作是特别令人兴奋的,因为它涉及计算和病毒学和医学专家之间的密切互动。一旦我们创建的映射,我们测试了它的可靠性,由数以百计的预测以及某些菌株可能匹配,然后进行化验检查的预测​​。,这是十分可喜的,这个基本的研究也具有实际应用的一个重要的人类病原体,流感。“

据专家估计,流感疫情造成全世界每年约有50万人类死亡。虽然抗体流感病毒感染提供保护性免疫,刺激免疫反应的蛋白质,的抗原结构变化显著随着时间的推移,被称为抗原漂移的过程,所以在大多数年份的流感疫苗已进行更新,以确保足够的疗效对新出现的变种。

此外,以Lapedes,小组成员包括从英国剑桥大学德里克史密斯,和罗恩Fouchi和他的同事扬德容,西奥Bestebroer,希丁克Rimmelzwaan和阿尔伯特奥斯特豪斯在Erasmus医学中心从国家流感中心。

http://www.lanl.gov/