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बड़े पैमाने पर कंप्यूटर सिमुलेशन सार्स समझने में मदद

Published on August 17, 2004 at 11:16 AM · No Comments

एक मेयो क्लीनिक तीन आयामी (3 डी) के एक घातक की प्रतिकृति के लिए जिम्मेदार एंजाइम की मॉडल की एक श्रृंखला विकसित करने के लिए पहली शोधकर्ता है सार्स (सीवियर एक्यूट रेस्पिरेटरी सिंड्रोम) वायरस.

इन तात्कालिक "संरचनाओं में समय" एक विरोधी सार्स दवा डिजाइन करने के लिए केंद्रीय हैं और इसलिए एक स्वागत योग्य अग्रिम के रूप में वायरस के लिए सार्वजनिक स्वास्थ्य के लिए खतरा बनी हुई है.

संरचना और गतिशीलता सार्स वायरल एंजाइम chymotrypsin तरह सिस्टीन proteinase कहा जाता है, पत्रिका के ऑनलाइन संस्करण में वर्णित है संरचना, समारोह, और जैव सूचना विज्ञान : प्रोटीन. मेयो क्लीनिक के शोधकर्ता युआन पिंग वेदना, पीएच.डी., और आण्विक कंप्यूटर एडेड डिजाइन प्रयोगशाला के केमिस्ट सिर, वह डिजाइन terascale कंप्यूटर द्वारा उत्पादित रिपोर्ट के परिणाम, बनाया है और प्रबंधित. 800 पीसी प्रोसेसर एक साथ इस्तेमाल का प्रयोग, डा. वेदना का विश्लेषण सार्स वायरल जीनोम और निर्माण, परमाणु द्वारा परमाणु, वायरल एंजाइम की तात्कालिक 3D संरचनाओं - सिर्फ 20 दिनों के बाद - जिनमें से प्रत्येक 8113 परमाणुओं से बना है सार्स वायरल जीनोम था सार्वजनिक किया.

असाधारण बड़े पैमाने पर कंप्यूटर सिमुलेशन, जो अपने शक्तिशाली कंप्यूटर प्रणाली प्रदर्शन करने में सक्षम है प्रदर्शन, डा. वेदना जल्दी और सही ढंग से से एक प्रोटीन है कि एक दवा विरोधी सार्स के लिए खाका encodes के 3D संरचनाओं में एक जीनोमिक अनुक्रम में परिवर्तित करने में सक्षम था. इस क्षमता जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स के उभरते क्षेत्रों से उपलब्ध जानकारी को पचाने में और उभरते संक्रामक रोगों का मुकाबला करने में महत्वपूर्ण है. यह काम भी कम लागत, जैविक प्रणालियों की बड़े पैमाने पर सिमुलेशन के लिए "घर का कंप्यूटर" के सफल प्रयोग को दर्शाता है.