Un investigador de la Clínica de Mayo es el primer para desarrollar una serie de los modelos tridimensionales (3D) de una enzima responsable de la réplica del virus mortal del SARS (Neumonía Asiática).
Este el “estructura-en-tiempo instantáneo” es central a diseñar una droga anti-SARS -- y está por lo tanto un avance agradable a medida que el virus continúa amenazar a salud pública.
La estructura y la dinámica de la enzima viral del SARS, llamadas quimotripsina-como la proteinasa de la cisteína, se describe en la versión en línea de las Proteínas del gorrón: Estructura, Función, y Bioinformática. Punzada del Yuan-Silbido de bala del investigador de la Clínica de Mayo, Ph.D., un químico y jefe del Laboratorio Molecular Automatizado del Diseño, resultados de los partes producidos por el ordenador del terascale que él diseñó, que construyó y que manejó. Usando 800 procesadores de la PC aprovechados juntos, el Dr. Pang analizaba el genoma viral del SARS y lo construyó, el átomo por el átomo, las estructuras instantáneas 3D de la enzima viral -- que se compone de 8.113 átomos -- apenas 20 días después del genoma viral del SARS fueron hechos públicos.
Realizando las simulaciones por ordenador excepcionalmente en grande, que su sistema informático potente es capaz de la ejecución, el Dr. Pang podía convierte a rápidamente y correctamente una serie genomic en las estructuras 3D de una proteína que codifica la heliografía para una droga anti-SARS. Esta capacidad es crucial en el resumen de la información disponible de los campos emergentes de la genómica y del proteomics y en enfermedades infecciosas emergentes de combate. Este trabajo también demuestra el uso acertado de barato, los ordenadores “hechos en casa” para las simulaciones en grande de sistemas biológicos.