O modelo de Computador do ADN danificado dobra as regras

Nossos joelhos podem tornar-se duros quando feridos, mas o ADN acima golpeado torna-se flexível, sugere o modelo de computador o mais detalhado do ADN danificado até agora. Mais, esta flexibilidade explica como as enzimas do corpo reconhecem e fixam o ADN danificado.

“Há muita discussão na literatura sobre como o ADN danificado é reconhecido pelas enzimas do reparo,” disse Maciej Haranczyk, um cientista do pessoal no Ministério do Laboratório Nacional Noroeste Pacífico da Energia em Richland, Washington “que A imagem actual é que algumas enzimas dobram o ADN danificado a fim reparar fragmentos alterados. Mas ninguém soube porque o ADN danificado era mais suscetível à dobra.”

Haranczyk e a simulação dos colegas, relatada Domingo na reunião nacional da Sociedade de Produto Químico Americano, oferecem uma explicação. Primeiramente, programaram uma mudança química a um fragmento intacto do ADN. Como com ADN real, a espinha dorsal da molécula simulada transformou-se pares distorcidos e seus baixos deslocados. A mudança estrutural correspondeu com uma mudança na forma da molécula, em sua energia e como as cargas elétricas são distribuídas durante todo a molécula.

“Todas estas características são significativas no reconhecimento enzimático do local danificado,” Haranczyk disse. “Em nosso modelo, dano provoca uma reorganização do açúcar-fosfato na espinha dorsal do ADN tais que o ADN se torna mais fino. No ADN danificado, negativamente - os grupos cobrados do fosfato migram ao longo da linha central do ADN, e aquele permite que a molécula dobre-se facilmente. Nós acreditamos que é esta diferença no ADN danificado e intacto que as enzimas reconhecem.”

Haranczyk disse que esta era a primeira simulação da química do quantum para examinar um sistema biológico tão grande--neste caso, um fragmento do ADN compo de 350 átomos. “Com um sistema tão grande, um não pode fazer este tipo do trabalho sem um super-computador. Felizmente, nós tivemos o acesso a um dos computadores os mais poderosos do mundo 10,” abrigado no Laboratório de Ciências Molecular de W.R. Wiley Ambiental no terreno de PNNL.

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