损坏的脱氧核糖核酸计算机模型弯曲规律

我们的膝盖也许变得僵硬，当伤害，但是损坏的脱氧核糖核酸变得灵活，迄今建议损坏的脱氧核糖核酸最详细的计算机模型。 进一步，此灵活性解释机体的酵素如何认可并且修理损坏的脱氧核糖核酸。

“有在文件的很多论述关于损坏的脱氧核糖核酸如何由维修服务酵素认可”，说 Maciej Haranczyk，能源部的一位人员科学家和平的西北国家实验室在 Richland，华盛顿 “这张当前照片是有些酵素弯曲损坏的脱氧核糖核酸为了修理修改过的片段。 但是没人知道损坏的脱氧核糖核酸为什么是易受弯曲”。

Haranczyk 和同事的模拟，报告星期天在美国化学会国家会议上，提供说明。 首先，他们编程了对一个完整脱氧核糖核酸片段的化学变化。 与实际脱氧核糖核酸，被模拟的分子的中坚成为被偏移的误解的和其基本对。 结构变化对应与在分子的形状上的一个变化，在其能源，并且电荷如何被分配在这个分子中。

“所有这些功能是重大的在这个损坏的站点的酶识别”， Haranczyk 说。 “在我们的设计，故障触发糖磷酸盐的重新组织在脱氧核糖核酸的中坚的这样脱氧核糖核酸变得更加稀薄。 在损坏的脱氧核糖核酸，带负电荷的磷酸盐组沿脱氧核糖核酸的轴移居，并且那允许这个分子容易地弯曲。 我们相信它是在酵素认可的损坏的和完整脱氧核糖核酸上的此区别”。

Haranczyk 说这是调查第一数量化学的模拟这样一个大生物系统--在这种情况下，脱氧核糖核酸片段由 350 个原子制成。 “与很大的系统，一不能执行这种工作没有巨型计算机。 幸运地，我们得以进入到世界的 10 最强大的计算机之一”，安置在 PNNL 校园的 W.R. 威里 Environmental 分子科学实验室。

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