損壞的脫氧核糖核酸計算機模型彎曲規律

我們的膝蓋也許變得僵硬，當傷害，但是損壞的脫氧核糖核酸變得靈活，迄今建議損壞的脫氧核糖核酸最詳細的計算機模型。 進一步，此靈活性解釋機體的酵素如何認可并且修理損壞的脫氧核糖核酸。

「有在文件的很多論述關於損壞的脫氧核糖核酸如何由維修服務酵素認可」，說 Maciej Haranczyk，能源部的一位人員科學家和平的西北國家實驗室在 Richland，華盛頓 「這張當前照片是有些酵素彎曲損壞的脫氧核糖核酸為了修理修改過的片段。 但是沒人知道損壞的脫氧核糖核酸為什麼是易受彎曲」。

Haranczyk 和同事的模擬，報告星期天在美國化學會國家會議上，提供說明。 首先，他們編程了對一個完整脫氧核糖核酸片段的化學變化。 與實際脫氧核糖核酸，被模擬的分子的中堅成為被偏移的誤解的和其基本對。 結構變化對應與在分子的形狀上的一個變化，在其能源，并且電荷如何被分配在這個分子中。

「所有這些功能是重大的在這個損壞的站點的酶識別」， Haranczyk 說。 「在我們的設計，故障觸發糖磷酸鹽的重新組織在脫氧核糖核酸的中堅的這樣脫氧核糖核酸變得更加稀薄。 在損壞的脫氧核糖核酸，帶負電荷的磷酸鹽組沿脫氧核糖核酸的軸移居，并且那允許這個分子容易地彎曲。 我們相信它是在酵素認可的損壞的和完整脫氧核糖核酸上的此區別」。

Haranczyk 說這是調查第一數量化學的模擬這樣一個大生物系統--在這種情況下，脫氧核糖核酸片段由 350 個原子製成。 「與很大的系統，一不能執行這種工作沒有巨型計算機。 幸運地，我們得以進入到世界的 10 最強大的計算機之一」，安置在 PNNL 校園的 W.R. 威里 Environmental 分子科學實驗室。

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