에서 연구원 국립 암 연구소 (NCI)는 성공적으로 neuroblastoma (NB)로 진단 환자의 임상 결과를 예측하기 위해 인공 신경망 (앤)와 DNA를 microarrays를 사용했습니다.
앤 또한 표현 수준이 밀접하게 임상 결과와 관련된 19 유전자의 최소 집합을 식별. 현재, NCI 후원 어린이 종양학 그룹 (예지)는,로 neuroblastoma 환자를 stratifies 높은, 중급 및 여러 가지 요인에 따라 낮은 위험 그룹. 그러나, 충화 환자 치료를 안내 수 있지만, 그것은 생존의 예측되지 않습니다. 이제 앤과 함께 microarray 유전자 표현 분석의 예측 능력은 개별 환자의 치료 의사를 도와 수 있습니다.
신경 회로망은 인간의 두뇌를 모방한 특수 패턴 인식 알고리즘을하는자는 복이 있나니 저희가 경험에 의해 배우게됩니다. 앤은 종종 같은 지문이나 음성 인식 소프트웨어와 같은 식별 프로그램에 사용됩니다. Javed 칸, MD, 그리고 NCI의 소아 종양학 지점에서 그의 팀은, NB 종양 유전자 발현의 패턴을 식별하는 앤 알고리즘을 적응. 은 10 월 2004 년 암 연구 *에 나타납니다 연구는, NCI, 독일 및 호주의 동료와 공동으로 수행되었습니다.
첫째, 연구자들은 누구의 임상 결과가 알려진주의 진단을 49 환자에서 일차 종양의 글로벌 유전자 발현 프로파일을 만들 수 25,000 유전자 이상 포함하는 cDNA microarrays를 사용하여 유전자 발현 분석을 수행했습니다. 환자 중 좋은 (이상 3 년 동안 이벤트 무료 생존) 또는 가난한 (질병에 의한 사망) 결과 그룹으로 나누어되었다. "별도로 독립적인 테스트 샘플을 설정, 신경 네트워크가 나머지 샘플에서 표현 프로필을 인식 또는 '살아있는'또는 '죽은'를 예측하는 훈련을했다"칸 말했다. "우리가이 훈련 앤를 사용하여 테스트 샘플에 대한 결과를 예측할 수있다면 그렇다면 우리는 결정." 그들은 앤가 88 % 정도의 정확도로 개별 유전자 프로필에서 임상 결과를 예측할 수있다는 사실을 발견했습니다.
이러한 유전자 프로파일 2 만 5 천 이상의 유전자로 구성되어 있듯이, 연구자들은 프로필을 최적화하고 예측 세트의 역할을 수있는 유전자의 최소 숫자를 찾으려고. 앤 누구의 표현 수준을 정확하게 임상 결과를 예측할 수있는 유전자를 발견 19. 이러한 19 유전자에서 볼 때, 앤 예측 정확도가 95 % 증가하고, 현재 어린이 종양학 그룹 (예지) 위험 충화보다 훨씬 더 잘 수행했습니다. 와 다른 유전자의 몇몇이의 연결을 개발에 참여하는 것으로 알려져 있습니다 -이 그룹 MYCN과 CD44에 유전자의 두는 이전에 다음 ID로 NB 예후 (豫 后) - MYCN 증폭에 연결되어있다면 가난한 예후의 가장 강한 독립적인 요인 중 하나입니다.
19 예측의 유전자를 사용하여 앤도 파티션 좋은 가난한 결과 그룹으로 위험도가 높은으로 분류된 환자의 하위 집합을 수 있었다. "가장 흥미로운 게 무슨"칸은 우리가 기존 치료에 실패한 것이 위험도가 높은 환자 중 어떤 예측할 수 있다고 "했다. 우리가 지금 초고 위험 그룹을 구별할 수 있기 때문에이 주요 임상 의미를 가지고 기존 치료에 반응하기 때문에 다른 치료 전략을 필요로하지 않습니다. 환자는 또한 강도를 감소시키고 그들의 유전자 발현 프로파일을 기반으로 생존을 위해 예측들에게 치료 정권의 독성을 줄일 수 있습니다. "
"그리고 우리는 25000 대신 19 유전자를 사용하여 있기 때문에,"칸 간단한 전조 assays이 유전자의 소수를 기반으로 개발할 수 있기 때문에 우리가 병원에 우리의 결과를 번역할 수 있습니다 "라고 덧붙였다. 사실, 유전자 세 될 것으로 그들은 간단한 혈액 검사에서 혈청 예후 마커로 사용될 수 의미, 혈액으로 분비 단백질을 인코딩 가난한 결과의 종양에서 과잉 표현. " 업계와 공동으로, 칸의 실험실 지금이 19 유전자를 기반으로하고 전조 예측에 대한주의와 다른 환자에서 이러한 혈청 마커의 존재에 대한 테스트 계획 임상 assays을 개발하고있다.
칸 더 검증 연구가 필요하는주의. 그의 연구실은 현재 미국 (예지)과 영국 (영국 아동 암 연구 그룹 UKCCSG)에 본사를 둔 국가 시험에서 300 NB 종양 샘플을 사용하여 큰 유효성 연구를 시작했다.
http://www.nci.nih.gov