कैंसर अनुसंधान के लिए एक को बढ़ावा देने में, प्रिंसटन वैज्ञानिकों क्रोमोसोम होते हैं कि जब कोशिकाओं को घातक हो करने के लिए परिवर्तन की पहचान के लिए एक तेज और विश्वसनीय विधि का आविष्कार किया है. तकनीक को दिखाने के लिए कैसे कोशिकाओं को अपने स्वयं के आनुवंशिक मेकअप को संशोधित करने और कैंसर के उपचार के एक रोगी के रोग के लिए अधिक सटीक अनुरूप अनुमति दे सकता है में मदद करता है.
कैंसर की कोशिकाओं को उनके उल्लेखनीय कुछ जीन और अति दूसरों को अक्षम करने की क्षमता के लिए जीव के बीच में जाना जाता है, उनके ट्यूमर में अनियंत्रित विकास की अनुमति. इन विकृतियों के सबसे आक्रामक होता है जब कोशिकाओं को हटाना या अपने स्वयं के क्रोमोसोम के विखंडू गुणा. कक्ष गुणसूत्र से जीन के तार बस कटाव कर सकते हैं या स्ट्रिंग के कई अतिरिक्त प्रतियाँ बनाने और इसे गुणसूत्र में फिर से शामिल करना.
अब तक, वैज्ञानिकों कोई दिनचर्या के लिए बहुत बड़े पैमाने पर विलोपन या परिवर्धन के लिए छोड़कर इन परिवर्तनों का पता लगाने के लिए रास्ता था. छोटे, लेकिन महत्वपूर्ण परिवर्धन श्रमसाध्य, जीन जीन खोजों की आवश्यकता गुणसूत्रों के विलोपन या ढूँढना. कंप्यूटर विज्ञान और जीव विज्ञान के संयोजन , प्रिंसटन सभी किसी कक्ष में निहित जीन - वैज्ञानिक ओल्गा Troyanskaya, स्नातक छात्र चाड मायर्स और अन्य सहयोगियों के जल्दी से एक पूरे जीनोम का विश्लेषण करने के लिए एक विधि का आविष्कार किया और गुणसूत्र वर्गों के एक विश्वसनीय सूची है कि या तो किया गया है उत्पादन या नष्ट जोड़ा.
"समस्या एक बहुत बड़ी एक भाषा तुम पूरी तरह से समझ में नहीं आता में लिखी किताब में typos के खोजने के लिए समान है" Troyanskaya, कंप्यूटर विज्ञान और विभाग में एक सहायक प्रोफेसर ने कहा कि लुईस Sigler एकीकृत जीनोमिक्स के लिए संस्थान. "आप सभी जानते व्याकरण और वाक्यविन्यास के कुछ सामान्य नियम हैं यह आप साल लेने के लिए हाथ से करना होगा, और यह भी एक कंप्यूटर के साथ बहुत मुश्किल है."
Troyanskaya और मायर्स जीनोमिक्स उपकरणों से डेटा है कि एक बार में जीनों के हजारों की पहचान और सक्रिय वे कैसे उपयोग किया जा रहे हैं दिखाने के साथ शुरू कर दिया. वे उन्नत सांख्यिकीय तकनीकों का इस्तेमाल करने के लिए इस डेटा का विश्लेषण और सही विलोपन और फाईल का पता लगाने के जीनों के हजारों के दसियों के बीच में कुछ के रूप में छोटे रूप में चार या पाँच जीन.
उपलब्धि अंतःविषय पर्यावरण के मूल्य लुईस Sigler एकीकृत जीनोमिक्स के लिए संस्थान द्वारा बढ़ावा दिखाता है, Troyanskaya कहा. "समस्या आप लोग हैं, जो कंप्यूटर विज्ञान, सांख्यिकी, और जीव विज्ञान को समझने की जरूरत है की इस तरह के लिए," उसने कहा. "किसी भी पक्ष इसे अकेले कर सकता है."
उनके निष्कर्षों पत्रिका बायोइनफॉरमैटिक्स के एक आगामी संस्करण में प्रकाशित किया जाएगा और पत्रिका वेब साइट पर 29 जुलाई को तैनात थे. Troyanskaya और मायर्स लुईस Sigler साथी मैत्रेय Dunham और इलेक्ट्रिकल इंजीनियरिंग सूर्य युआन कुंग के प्रोफेसर के साथ सहयोग में पत्र लिखा था.
शोधकर्ताओं खमीर के रूप में के रूप में अच्छी तरह से कोशिकाओं मानव स्तन कैंसर की कोशिकाओं के लिए उनकी तकनीक आवेदन किया है और कई पहले से अज्ञात परिवर्धन और विलोपन पाया. परिणाम कुछ जीव है कि गुणसूत्र परिवर्धन और विलोपन अधिक आम है की तुलना में पहले माना जाता है के द्वारा प्रस्तावित विचार का समर्थन करते हैं.
"यदि वास्तव में एक सेल अपने व्यवहार काफी बदल करना चाहता है, सबसे तेज़ तरीका है बस को बढ़ाना या गुणसूत्र का एक हिस्सा हटाने के है - अगर यह एक कैंसर कोशिका या अपने वातावरण में कुछ बदल गया है" Troyanskaya कहा. "हम इन विलोपन और amplifications बहुत सही पहचान की जरूरत है."