細胞の数千人の間でDNAの変異を特定するための新しい分子ツール

科学者は、細胞の数千人の間で本の全体のライブラリの誤字、単一の検索と同等のものをDNAの変異を特定する"、LigAmp"と呼ばれる新しい分子ツールを、設計している。細胞株および体液の少数の予備的研究では、超高感度テストが微小癌やHIVの薬剤耐性の検出に役立つことを示す。

"他の分子のテストはそれが非常に困難な変異を持っていない他のセルの数千に囲まれた特定の細胞の変異を見つけることができるよう、"からの同僚と研究を主導したジェームズEshleman、MD、博士は、 病理学のジョンズホプキンス大学学科とキンメルがんセンター 。 "LigAmpは本質的に正常細胞に起因するバックグラウンド"ノイズ"をフィルタ処理し、特定の変異を明らかにする。"

研究者は、変異を見つけるために感受性試験は、疾患のハイリスク患者の癌を識別することができると言う。このようなテストでも変異の数が所定のしきい値を上回るかどうかを監視することによって、がんの再発を検出するのに役立ちますことができます。

癌の検出に加えて、ホプキンスの突然変異-ファインダーは、薬剤耐性HIVを検出することが表示されます。チームは、HIVと特定の抗レトロウイルス薬へのそれに耐えるよう、ウイルス自体に位置するDNAのミスと患者のほんの一握りから血液サンプルでテスト。新しいテストの分析の結果は、自然法の11月号に掲載されています。

"我々はウイルスと細胞のDNAに非常に微妙な変化を探す方法を改善するためにLigAmpを設計された、"Eshleman、病理学や腫瘍学の助教授とジョンズホプキンス大学でDNA診断研究所の副所長は言う。 "正常な細胞の分子のコードでは、DNAラダー、構造内の単一のラングを除いて、癌と同じに見えるかもしれません。"

テストはまた、点突然変異として知られているDNAのミスのための親和性を有する分子"磁石"を、作成することによって機能します。突然変異が見つかった場合、磁石は、細菌の遺伝子をそれに結合し、挿入します。細菌の遺伝子は赤い旗として機能し、強力なコンピュータプログラムから見える蛍光色を生成します。

彼らの研究では、ホプキンスの研究者らは、がん患者の膵管から大腸癌細胞株に対するLigAmp、HIV患者の血液、体液をテストした。大腸癌細胞とHIV薬剤耐性ウイルスの単一の変異は、10,000分子で最大1の希釈率で検出された。 KRAS2遺伝子の変異はまた、腫瘍で見つかった変異に対応three膵臓癌の患者から、ダクトの流体試料中で検出された。 LigAmpはまた、3つのHIV患者からの血液サンプル中のK103Nと呼ばれる薬剤耐性変異を、、に位置。

より大きなサンプルサイズと臨床検体の盲目のパネルとLigAmpのさらなる分析は現在進行中です。

"いくつかの初期の研究では、我々は同時に、異なる変異を探して、現在の変異分子数を定量化できることを示している。これは、私たちはスクリーニングのための癌マーカーのパネルを構築し、変異の低または高レベルを判定するのに役立つ。"

この研究のための資金は、メリーランド州タバコ反発基金、国立がん研究所、及びアレルギーと国立感染症研究所によって提供されていました。

Eshlemanで作業ジョンズホプキンス大学の同僚はChanjuan市、スーザンEshleman、ダナジョーンズ、芳福島、李華、アントニーパーカー、チャールズヨー、ラルフHruban、そしてマイケルGogginsです。

http://www.hopkinsmedicine.org/~~ROOT~~V