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수천개의 세포 간의 DNA 변이를 정확하게하기위한 새로운 분자 도구

Published on October 28, 2004 at 8:51 AM · No Comments

과학자들은 수천개의 세포 간의 DNA 변이를 정확하게 "LigAmp"도서의 전체 라이브러리에서 오타 하나에 대한 검색의 상당 불리는 새로운 분자 도구를 설계했습니다. 세포 라인과 체액의 소수의 예비 연구 울트라 민감한 테스트 미세한 암 및 HIV의 약물 저항을 감지 도움이 될 수 있습니다 보여줍니다.

"다른 분자 테스트가 매우 어려운 변이가없는 다른 세포의 수천으로 둘러싸인 특정 세포에 돌연변이을 찾을 수 있도록"에서 동료와 함께 연구를 이끌 제임스 Eshleman, MD, 박사는 말합니다 병리학의 존스 홉킨스 부서Kimmel 암 센터 . "LigAmp은 본질적으로 정상 세포에 의해 발생 배경 '잡음'을 필터 및 특정 변이를 보여."

연구자들은 변이를 찾을 수 민감한 검사는 질병에 대한 위험도가 높은 환자에서 암을 식별 수 있다고 말한다. 이러한 테스트도 변이의 수가 미리 정해진 임계값 이상의 상승 여부를 모니터링하여 암의 재발을 감지 도움을 줄 수 있습니다.

암 탐지뿐만 아니라, 홉킨스의 변이 - 찾기 마약 방지 HIV를 감지할 수가 나타납니다. 이 팀은 HIV와 특정 antiretroviral 약물에 내성을 만들는 바이러스 자체에있는 DNA의 실수로 환자의 소수에서 혈액 샘플에 테스트. 새로운 시험의 분석 결과는 자연 방법의 11 월호에 게재됩니다.

"우리는 바이러스와 세포 DNA에 매우 미묘한 차이를 찾을 방법을 개선하기 위해 LigAmp을 설계,"Eshleman, 병리학 및 종양학의 조교수와 존스 홉킨스에​​서 DNA 진단 실험실에 대한 연관 이사는 말합니다. "정상 세포의 분자 코드는 DNA 사다리 구조에서 하나의 안울렸으면를 제외하고 암과 동일 보일 수 있습니다."

시험은 또한 포인트 돌연변이로 알려진 DNA의 실수에 대한 친화력을 가진 분자 "자석"을 생성함으로써 작동합니다. 변이가 발견되면 자석은 박테리아 유전자를 그것에 바인딩하고 삽입합니다. 세균 유전자는 빨간색 플래그 역할을하고 강력한 컴퓨터 프로그램을 볼 수있는 형광 색상을 생산하고 있습니다.

그들의 연구에서, 홉킨스의 수사는 결장 암 세포 라인, HIV 환자에서 혈액 및 암 환자의 췌장 덕트의 유체에 LigAmp을 테스트했습니다. 결장암 세포 및 약물 내성 HIV 바이러스의 단일 변이가 10,000 분자에서 1의 dilutions에서 발견되었습니다. KRAS2 유전자의 변이는 또한 종양에서 발견된 돌연변이로 통신을 세 췌장암 환자에서 덕트 액체 샘플에서 발견되었습니다. LigAmp 또한 세 HIV 환자의 혈액 샘플에서 K103N라는 약물 저항 돌연변이, 위치하고 있습니다.

큰 샘플 크기와 임상 샘플 멀게 패널 LigAmp의 자세한 분석은 현재 진행되고있다.

"몇몇 초기 연구는 우리가 동시에 서로 다른 돌연변이에 대한보고 현재 변이된 분자의 수를 수량 수 보여줍니다. 이것은 우리가 검사에 대한 암 마커 패널을 구축하고 돌연변이의 낮은 또는 높은 수준을 결정하는 데 도움이 될 수 있습니다."

본 연구에 대한 자금은 메릴랜드 담배 배상 기금, 국립 암 연구소와 알레르기 및 전염병 국립 연구소에 의해 제공되었다.

Eshleman 작업 존스 홉킨스의 동료 Chanjuan시, 수잔 Eshleman, 데이나 존스, Noriyoshi 후쿠시마, 리 후아, 안토니 파커, 찰스 Yeo, 랠프 Hruban, 그리고 마이클 Goggins 있습니다.

http://www.hopkinsmedicine.org/